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    Xenium | 数据输出与结果总览

    Xenium数据输出 在完成Xenium实验后,Xenium Onboard Analysis会生成一系列不同的输出文件和文件夹,其中一些文件的详细信息如下所述。...输出文件中还包含了细胞的位置、形态、分割信息,以及转录本的位置和基因表达情况等处理后的数据。同时,还提供了未经处理的原始数据,包括解码后的转录本计数结果以及实验过程中的细胞形态图像。...需要注意的是,输出文件的内容和格式可能会因所使用的软件版本而有所不同。...每个细胞的最终分割结果会按照以下优先级进行确定:(i) 细胞膜染色结果;(ii) 从细胞核向RNA染色区域扩展的情况;(iii) 细胞核的各向同性膨胀程度(膨胀范围为5微米)。...如果某个组织区域的荧光强度在各个周期及各个通道中都保持较高水平,那么这很可能是自体荧光的迹象;这种情况可能会影响转录本的检测结果,从而对后续分析产生不良影响。 每次实验/每个fov对应一个结果文件夹:

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    将MindSpore运行结果输出到log文件

    但是如果要将打印的结果输出到某个文件里面的话,这时候正确输出和错误输出就是需要分开指定了。...并且为了对比输出的结果,我们把MindSpore的Log等级设置为1,也就是Debug级别,这个级别下运行MindSpore程序能够最充分的打印所有的提示信息: $ export GLOG_v=1 然后看一下直接运行的结果.../pipeline.cc:2338] ClearResAtexit] End unload dynamic lib... $ cat test.log 2.2.11 按照正常来说,我们选择将程序运行的结果输出到...这里1表示正确的输出结果,在这个案例中正确输出结果就是我们所打印的版本号信息。...而2表示的是一个错误输出结果,1和2默认都是把输出结果指向到屏幕输出,可以看到第一次案例运行的时候,屏幕上既输出了版本号,也输出了提示信息。

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