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序列比对的长度限制

以前没注意过这些比对算法对长度的要求,此文记录一下。...MUSCLE再linux上的使用之前介绍过: Linux下运行MUSCLE MUSCLE对序列长度没有明确的限制,但是使用32位软件的时候,能够出结果的最大长度约为10,000。...在MUSCLE官网还有文章讨论了多条序列的比对是否有意义。作者认为对于多序列比对,几乎不可能得到一个良好的比对结果。多重比对隐含的假定为唯一重要的突变是置换、短随机序列的插入和删除。...这对于少数密切相关的序列来说是一种合理的简化,但是随着序列散度或序列数量的增加,这种简化越来越不准确。...作者提出一种减少数据集的方法,即先用UCLUST 95%或90%进行聚类,得到较少的保守区序列,再进行比对。 MAFFT最多可比对∼20,000 sequences × ∼30,000 sites。

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MySQL中索引的长度的限制

参考: http://dinglin.iteye.com/blog/1681332 单列索引的长度的限制     (5.6里面默认不能超过767bytes,5.7不超过3072bytes):     起因是...255×4>767, 于是增加了一个参数叫做 innodb_large_prefix     # 256的由来: 只是因为char最大是255,所以以前的程序员以为一个长度为255的index就够用了,...--- by 阿里-丁奇 在MySQL5.6里默认 innodb_large_prefix=0 限制单列索引长度不能超过767bytes    官网文档:https://dev.mysql.com/doc...在MySQL5.7里默认 innodb_large_prefix=1 解除了767bytes长度限制,但是单列索引长度最大还是不能超过3072bytes 联合索引的长度的限制 (不能超过3072bytes...又由于InnoDB的聚簇索引结构,一个二级索引要包含主键索引,因此每个单个索引不能超过4k (极端情况,primay-key和某个二级索引都达到这个限制)。

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    String还有长度限制?是多少?

    前言 话说Java中String是有长度限制的,听到这里很多人不禁要问,String还有长度限制?是的有,而且在JVM编译中还有规范,而且有的家人们在面试的时候也遇到了。...本人就遇到过面试的时候问这个的,而且在之前开发的中也真实地遇到过这个String长度限制的场景(将某固定文件转码成Base64的形式用字符串存储,在运行时需要的时候在转回来,当时文件比较大),那这个规范限制到底是怎么样的...[1240] 那么String既然是数组存储那数组会有长度的限制吗?是的有限制,但是是在有先提条件下的,我们看看String中返回length的方法。...10的数组 int[] arr2 = {1,2,3,4,5}; // 那么此时数组的长度为5 整数在java中是有限制的,我们通过源码来看看int类型对应的包装类Integer可以看到,其长度最大限制为...[1240] [1240] 看到这里我们来总结一下: 字符串有长度限制吗?是多少?

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    varchar有最大长度限制吗

    先说结论,mysql 中的 varchar 是有最大长度限制的,这个值是 65535 个字节。 varchar(100),这个 100 的单位是啥,这个单位其实在不同版本中是不一样的。...另外 char 也是有最大长度限制的,最大长度为 255, 即 char 类型最多只能保存 255 个字符,char(256) 这都是错误的写法,可以看下面的例子。...:一个字符最多占 4 个字节 好了,再坚持一会,回到文章开头的问题,为啥 varchar 最大长度是 65535 个字节呢,其实这个是受 mysql 另一个规则限制导致的,mysql 规定了每行数据大小不能超过...length too big for column 'address' (max = 21845); use BLOB or TEXT instead 基于上面几个实例,基本上可以得出计算 varchar 最大长度限制的公式...varchar 最大长度限制 = (行最大字节数(65535) - null 标识字节数 - 长度前缀字节数(1或2)) / 字符集单字符占用最多字节数 看到这里,不知道你有没有一个疑问,为什么长度前缀

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    技术分享 | MySQL 索引长度限制的案例

    我们知道,MySQL 和 Oracle 在索引上最大的一个区别,就是索引存在长度的限制。如果是超长键值,可以支持创建前缀的索引,顾名思义,取这个字段的前多少个字符/字节作为索引的键值。...对于非二进制的字符串类型(CHAR、VARCHAR、TEXT),前缀会按照字符个数计算,对二进制的字符串类型(BINARY、VARBINARY、BLOB),前缀会按照字节个数计算,因此,当对非二进制的字符串列明确前缀长度的时候...MySQL 官方手册索引的章节提到了,前缀索引长度限制是和引擎相关的,如果用的是 InnoDB ,前缀上限是 767 字节,当启用 innodb_large_prefix 时,上限可以达到 3072 字节...之所以需要 utf8mb4 ,是因为之前的 utf8 编码最大字符长度为 3 字节,如果遇到 4 字节的宽字符就会插入异常了。...我们可以测下 MyISAM ,utf8mb4 编码表 test1 ,250长度的字段 c1 ,251长度的字段c2 , CREATE TABLE test1 (c1 varchar(250), c2

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    Discourse 如何限制注册用户的密码长度

    在默认的情况下 Discourse 限制用户输入密码的长度要超过 10 个字符。 这个实在是太长了,用户交互性不好。 如何修改这个密码长度到 6 位?...你可以登录后台的管理员界面,然后搜索关键字 password 你可以看到上面有 2 个选项,一个是登录用户的密码,一个是管理员的密码。...在默认情况下,登录用户的密码是 10 位,管理员的密码是 15 位。 系统允许的最短的密码位数为 8 位。 所以你是没有办法设置到 6 位的。...为了更好的交互,我们建议登录用户的密码设置为 8 位,管理员的密码可以考虑设置为 10 位,或者都设置为 8 位。 你可以修改上面的配置,然后保存就可以了。 修改配置后,保存退出。

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    小白学习MySQL - 索引键长度限制的问题

    MySQL中还会对索引键的长度有限制?.../en/create-index.html 前缀的长度限制,是和存储引擎相关的。...再看一下《MySQL 5.7 Reference Manual》,相同章节中,多了这段描述,是说当使用CREATE INDEX时,如果指定的索引前缀长度超过了列定义的长度上限,则会出现以下两种场景, 非唯一索引...缩小字段长度,例如x varchar(500),改为x varchar(255)。 2. 创建索引的时候,指定前缀长度,alter table ... add index ......,换算成utf8,或者utf8mb4,至少是255或者191个字符的长度,一个单键值索引,如果达到这长度,就得考虑下索引字段的选择是否合理了,当然如果是几个字段组成的复合索引,达到这个长度,合理不合理,

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    Memcached对于Key和Value的长度默认限制

    结论 Memcached默认对Key和Value长度做如下限制: Key字符串的长度不能超过255个字符; Value字符串的长度不能超过1024 * 1024个字符, 即存储数据不能超过1M; 推荐使用默认配置..., 也可以通过直接修改memcached.h源码来加大长度限制. // memcached.h#define KEY_MAX_LENGTH 1000#define MAX_ITEM_SIZE  (1024..., item的值超过某个阈值(当前是100bytes)时, 会首先对值进行压缩然后存储, 并在获取该值时进行解压缩然后返回, 使得压缩对应用层透明....var_dump($ret); $values=array();// 为什么是85呢, 因为存储$value数据需要额外存储其它元素数据, 包括key, 管理信息// 每记录需要内存数 = key长度...+ value长度 + 管理信息(64 字节 + 1~9字节的value size的字符数).// 14 + 1024 * 1024 - 85 + 1 + 64 + 7 = 1024 * 1024 +

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    如何取消Chrome浏览器跨域请求限制、跨域名携带Cookie限制、跨域名操作iframe限制?

    取消跨域限制、跨域名携带Cookie限制、跨域名操作iframe限制之后的Chrome可以更加方便Web前端开发,同时也可以作为一个完美的爬虫框架。...所有版本的Chrome浏览器下载:https://lanzoui.com/b138066 跨域请求限制 1.什么是跨域请求限制? 当协议、子域名、主域名、端口号中任意一个不相同时,都算作不同域。...假设接口需要登录,就算我们已经登录了,跨域访问B域名接口因为没有携带Cookie,请求也是没有登录状态的。 2.如何解除限制?...跨域名操作iframe 1.什么是跨域名操作iframe限制?...假设我们在A域名的网页上有一个指向B域名的iframe,我们访问A域名的网页时,B域名的iframe正常显示,但是当我们通过js去操作B域名的iframe时,将会被浏览器阻止(同源域名不会被阻止);相应的通过

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