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社区首页 >问答首页 >Pandas str.contains()在某些情况下不起作用

问Pandas str.contains()在某些情况下不起作用
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Stack Overflow用户
提问于 2021-01-22 18:54:05
回答 1查看 64关注 0票数 1

我有一个脚本，它在条件对之间进行线性建模:数据帧如下所示：

代码语言：javascript
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   Accession                                   Sequence variable        value
0     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO    39.300171
1     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO   132.637125
2     O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO  1165.245826
3     O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO   642.971908
4     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO    83.906058
5     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO   160.718841
6     O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO  1240.856710
7     O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO   557.508092
8     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO    56.228425
9     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO   302.346775
10    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO  1176.998098
11    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO   766.993819
12    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP     0.387985
13    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP     0.175678
14    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP   885.174420
15    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP   130.458963
16    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP     0.557088
17    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP     0.095801
18    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP   612.171540
19    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP    46.449990
20    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP     6.016590
21    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP     0.466220
22    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP   586.392482
23    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP   303.857624
24    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]      C+I    44.627773
25    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]      C+I     0.841494
26    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]      C+I   632.355914
27    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]      C+I   162.333292
28    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]      C+I    12.075158
29    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]      C+I   154.253098
30    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]      C+I   159.767999
31    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]      C+I  1031.399087
32    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]      C+I   150.724386
33    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]      C+I   260.684163
34    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]      C+I   141.459156
35    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]      C+I   262.659208

我现在想为每一对都拟合一个线性模型。我通过以下代码获得对：

代码语言：javascript
复制
def tessa(source):
    result = []
    for p1 in range(len(source)):
            for p2 in range(p1+1,len(source)):
                    result.append([source[p1],source[p2]])
    return result

unique_conditions = list(set(conditions))
pairs = tessa(unique_conditions)
print(pairs)

我循环遍历这些对，并按dataframe过滤条件：

代码语言：javascript
复制
for pair in pairs:
        
        pair.sort()
        print(pair)
        print(pair[0],pair[1])
        temp=melted_Peptides[(melted_Peptides['variable'].str.contains(pair[0]))|(melted_Peptides['variable'].str.contains(pair[1]))]
        print(temp)

问题来了。它不能正确过滤以下内容的.The输出：

代码语言：javascript
复制
['C+I', 'CCCP']
C+I CCCP
   Accession                                   Sequence variable       value
12    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP    0.387985
13    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP    0.175678
14    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP  885.174420
15    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP  130.458963
16    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP    0.557088
17    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP    0.095801
18    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP  612.171540
19    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP   46.449990
20    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP    6.016590
21    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP    0.466220
22    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP  586.392482
23    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP  303.857624

而对于下一次比较，它看起来还可以：

代码语言：javascript
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['CCCP', 'DMSO']
CCCP DMSO
   Accession                                   Sequence variable        value
0     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO    39.300171
1     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO   132.637125
2     O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO  1165.245826
3     O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO   642.971908
4     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO    83.906058
5     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO   160.718841
6     O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO  1240.856710
7     O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO   557.508092
8     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO    56.228425
9     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO   302.346775
10    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO  1176.998098
11    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO   766.993819
12    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP     0.387985
13    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP     0.175678
14    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP   885.174420
15    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP   130.458963
16    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP     0.557088
17    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP     0.095801
18    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP   612.171540
19    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP    46.449990
20    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP     6.016590
21    O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     CCCP     0.466220
22    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP   586.392482
23    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     CCCP   303.857624

对于第三个，它看起来又很奇怪：

代码语言：javascript
复制
['C+I', 'DMSO']
['C+I', 'DMSO']
C+I DMSO
   Accession                                   Sequence variable        value
0     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO    39.300171
1     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO   132.637125
2     O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO  1165.245826
3     O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO   642.971908
4     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO    83.906058
5     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO   160.718841
6     O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO  1240.856710
7     O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO   557.508092
8     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO    56.228425
9     O14548  [K].lAGAWASEAYSPQGLkPVVSTEAPPIIFATPTk.[L]     DMSO   302.346775
10    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO  1176.998098
11    O14548                          [R].gLPDQMLYr.[T]     DMSO   766.993819

我使用相同的代码来表示近似。5000个不同的数据帧，它总是有效的。这两个条件的名称完全相同，但在某些情况下，它会被打破。

有人能帮帮忙吗？

python
pandas
EN

回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2021-01-22 19:05:14

可以添加regex=False参数，以避免在Series.str.contains中将值转换为正则表达式

代码语言：javascript
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melted_Peptides['variable'].str.contains(pair[0], regex=False)
票数 1
EN
页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/65843780

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