为什么R和R的逻辑增长产出之间存在差异？

Question

df <- data.frame(
  time = c(0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17),
  var = c(12.69,16.35,20.29,25.08,30.81,38.75,45,49.16,55.15,62.852,68.63,76.64,82.47,85.68,89.14,91.86,95.28,98.17)
)

logisticmodel <- nls(var ~ SSlogis(time, phi1, phi2, phi3), data = df)
summary(logisticmodel)
coef(logisticmodel)
#predict(logisticmodel, data.frame(time = 18))

R给出的输出如下：

      phi1       phi2       phi3 
105.737368   7.432555   3.852865

但是the website给了我们：

​

​

我知道有些语言有不同的输出。这很正常，但我想知道你的想法是什么？

提前谢谢。

Answer 1

问题是，不同的模型是适合的。

具有自启动功能SSlogis的nls符合该模型(参见help('SSlogis'))

Asym/(1+exp((xmid-input)/scal))

或者，使用您的符号，

phi1/(1 + exp((phi2 - input)/phi3))

笔和纸显示，以下转换在网页中给出结果。

fit <- nls(var ~ SSlogis(time, phi1, phi2, phi3), data = df)

kappa <- coef(fit)[1]
alpha <- exp(coef(fit)[2]/coef(fit)[3])
beta <- 1/coef(fit)[3]
c(kappa = unname(kappa), alpha = unname(alpha), beta = unname(beta))
#      kappa       alpha        beta 
#105.7373679   6.8832991   0.2595471 

因此，为了自动化这一点，编写一个简单的函数。

transf <- function(x){
  kappa <- coef(x)[1]
  alpha <- exp(coef(x)[2]/coef(x)[3])
  beta <- 1/coef(x)[3]
  c(kappa = unname(kappa), alpha = unname(alpha), beta = unname(beta))
}

transf(fit)