在conda安装的julia中使用Gadfly

Question

对于将来在jupyter上下文中的使用，我想通过conda安装来试用julia。为此，我执行了以下操作：

conda create -n test_julia
conda activate test_julia
conda install -c conda-forge julia

从那里我可以让朱莉娅上场。但是，例如，当尝试使用gadfly模块进行基本的测试绘图时，我得到了以下错误：

julia>using Pkg
julia>Pkg.add("Gadfly")
julia>using Gadfly


Error: Error building `Arpack`: 
│ [ Info: Downloading https://github.com/JuliaLinearAlgebra/ArpackBuilder/releases/download/v3.5.0-3/Arpack.v3.5.0-3.x86_64-linux-gnu-gcc7.tar.gz to /home/pellegrini/.julia/packages/Arpack/UiiMc/deps/usr/downloads/Arpack.v3.5.0-3.x86_64-linux-gnu-gcc7.tar.gz...
│ ERROR: LoadError: LibraryProduct(nothing, ["libarpack"], :libarpack, "Prefix(/home/pellegrini/.julia/packages/Arpack/UiiMc/deps/usr)") is not satisfied, cannot generate deps.jl!
│ Stacktrace:
│  [1] error(::String) at ./error.jl:33
│  [2] #write_deps_file#152(::Bool, ::Function, ::String, ::Array{LibraryProduct,1}) at /home/pellegrini/.julia/packages/BinaryProvider/4F5Hq/src/Products.jl:414
│  [3] (::getfield(BinaryProvider, Symbol("#kw##write_deps_file")))(::NamedTuple{(:verbose,),Tuple{Bool}}, ::typeof(write_deps_file), ::String, ::Array{LibraryProduct,1}) at ./none:0
│  [4] top-level scope at none:0
│  [5] include at ./boot.jl:317 [inlined]
│  [6] include_relative(::Module, ::String) at ./loading.jl:1044
│  [7] include(::Module, ::String) at ./sysimg.jl:29
│  [8] include(::String) at ./client.jl:392
│  [9] top-level scope at none:0
│ in expression starting at /home/pellegrini/.julia/packages/Arpack/UiiMc/deps/build.jl:74

我读到这个问题可能是由于使用了从源代码构建的julia。我认为在使用conda安装时情况并非如此。作为conda和julia的新手，我找不到为什么会有这个错误以及如何解决它。你有什么想法吗？

Answer 1

通过Julia安装程序安装Julia，并将链接设为Julia=>Conda而不是Conda=>Julia。目前，所有主要的Julia=>Conda集成问题似乎都得到了解决，并且可以无缝地工作。这也是Python-Julia的标准工作方式，因此此场景也会更快地获得更新。

由于您可能希望将Julia粘合到现有的Anaconda安装(而不是为Julia安装私有Anaconda，后者是默认选项)，因此需要设置PYTHON环境变量(这可以在shell中或使用以下Julia命令完成)：

#Windows:
julia> ENV["PYTHON"]="C:\\ProgramData\\Anaconda3\\python.exe"
#Linux
julia> ENV["PYTHON"]="~/anaconda3/bin/python"

现在你可以按]进入包管理器，这是你通常想要执行的：

(v1.0) pkg> add PyCall Conda PyPlot

现在，您将拥有与外部Anaconda的集成。看看你的问题，这是最好的方案。

Answer 2

听起来可能是this known issue。基于对这个问题的讨论，我通过安装openblas并添加以下链接在我的机器上修复了这个问题：

ln -s /usr/lib/libopenblas.so /usr/lib/libopenblas64_.so.0

(请注意，我使用的不是conda，我使用的是标准的Arch包。)