我正在做一个项目,在这个项目中我需要检索rdf:人类/鼠标本体的标签值,并在这些标签上运行匹配器。但是,我似乎找不到一个内置的Owlready2方法可以返回本体中所有类的所有标签。我可以使用onto.classes()获得所有的类名,但这对我没有帮助,因为我不能从类名中获得标签。类名称在数据集中只有human.NCIXXXXX.格式的IRI
我使用的是OWL/RDF格式的OAEI2012数据集:http://oaei.ontologymatching.org/2012/anatomy/index.html (数据集的下载链接在dataset标题下)
下面是人类owl本体文件的一个片段:
<owl:Class rdf:about="http://human.owl#NCI_C33648">
<rdfs:label rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#string">Subiculum</rdfs:label>
<rdfs:subClassOf rdf:resource="http://human.owl#NCI_C13031"/>
<rdfs:subClassOf>
<owl:Restriction>
<owl:onProperty rdf:resource="http://human.owl#UNDEFINED_part_of"/>
<owl:someValuesFrom rdf:resource="http://human.owl#NCI_C12353"/>
</owl:Restriction>
</rdfs:subClassOf>
<oboInOwl:hasRelatedSynonym rdf:resource="http://human.owl#genid6200"/>
</owl:Class>onto.classes()返回human.NCI_C13031。我想要一个Python列表中的"subiculum“的标签值。
owlready2文档说,可以通过调用onto.search(label = "XXXXXX") (X = labelname)来检索基于指定标签的实体对象。然而,我想要的是相反的情况。我需要找回标签。我似乎找不到一种使用owlready2来做这件事的方法。有没有办法在有/没有owlready2的情况下做到这一点?我确实知道owlready2中有一个OWL/RDF解析器(owlready没有),我可以成功地读取该文件。我只需要一个特定的标签查询就行了。
请考虑我需要用Python来做这件事,而且我对Python也是非常陌生的。我尝试过ontospy,但它似乎没有本体查询的潜力,只是为了本体文档(如果我错了,请纠正我)。
谢谢!
编辑:我自己解决了。要获取标签,您可以将set render function设置为一个自定义函数,该函数接受一个实体并返回其标签。这一切都在owlready文档中:https://pythonhosted.org/Owlready2/annotations.html#custom-rendering-of-entities` `
发布于 2020-10-29 15:29:34
如果您有一个protege实体标签的实例,您可以使用以下命令:entity.label来获取<class 'owlready2.entity.ThingClass'>的值。
https://stackoverflow.com/questions/63703777
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