无法使用conda安装mpi4py并指定预先安装的mpicc路径

Question

我尝试使用以下命令安装mpi4py：

env MPICC=path/to/openmpi/bin/mpicc conda install -c anaconda mpi4py

但我得到了这样的信息：

The following NEW packages will be INSTALLED:
  mpi                anaconda/linux-64::mpi-1.0-mpich
  mpi4py             anaconda/linux-64::mpi4py-3.0.3-py37h028fd6f_0
  mpich              anaconda/linux-64::mpich-3.3.2-hc856adb_0

这似乎表明"MPICC=path/ to /openmpi/bin/mpicc“被忽略了。

实际上，在使用mpich安装mpi4py并尝试使用mpirun -n 2 python mpi4pyTest.py运行以下简单代码之后

from mpi4py import MPI
comm = MPI.COMM_WORLD
size = comm.Get_size()
rank = comm.Get_rank()
print('Hello from processor {} of {}'.format(rank+1,size))

输出为：

Hello from processor 1 of 1
Hello from processor 1 of 1

我怎样才能让conda把mpi4py和我自己的mpicc链接起来？其位置在PATH环境变量和LD_LIBARY_PATH中设置。

诚挚的问候。

Answer 1

conda install从存储库中提取预编译的二进制包及其依赖项。如果您希望使用自己的mpi4py实现构建MPI，请改用pip从源安装。您可以在Conda环境中使用pip。

编辑以完成

或者使用conda remove卸载所有包，然后使用pip安装mpi4py (将MPICC环境变量指定给您的MPI编译器)，或者从一个新环境开始。