如何格式化netCDF数据集以与Thredds OGC服务兼容

Question

我有一个从NASA LIS模型生成的netcdf数据集，我希望能够使用Thredds服务器通过WMS显示它。具体的数据集和thredds服务器可以在https://tethys.byu.edu/thredds/catalog/testAll/anomaly/catalog.html上找到，您也可以在那里下载数据集。

数据集的所有变量都具有时间、集合、经度和经度维度，少数变量具有附加维度。这些维度都有相应的变量。当我打开wms端点以查看xml时，我会在图层下看到

<Layer>
<Title>LIS land surface model output</Title>
</Layer>

但它下面没有变量的列表。我找不到任何关于Thredds所需的netcdf结构的文档，我尝试将其与其他数据集进行比较，以寻找差异，但我被卡住了。对目录文件进行配置，以便您可以读取.nc文件、公开wms服务等。

我需要修改什么才能使这个文件可被thredds读取？

Answer 1

THREDDS Data Server (TDS)附带了一个名为ncWMS的WMS服务器作为插件。简短的回答是，我不认为ncWMS适用于具有集成维度的数据，因为似乎没有一种方法可以通过getMap request请求集成成员。

如果我的理解是错误的，并且ncWMS将支持具有集成维度的数据，那么您需要确保netCDF-java能够识别示例数据集中的集成维度/变量(目前它还不能)。第一个问题是netCDF-java没有将集合变量视为坐标变量。要解决这个问题，可以向集合变量添加一个_CoordinateAxisType属性，告诉netCDF-Java它是一个坐标变量。您可以使用NcML来完成此操作，这样您就不需要重写文件：

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<ncml:netcdf xmlns:ncml="http://www.unidata.ucar.edu/namespaces/netcdf/ncml-2.2" location="/path_to_file/processed_LIS_HIST_201908010000.d01.nc">
  <ncml:variable name="ensemble">
    <ncml:attribute name="_CoordinateAxisType" value="Ensemble" />
  </ncml:variable>
</ncml:netcdf>

但是，示例数据集中的集合变量有两个维度，[ensemble, time]，这是netCDF-Java当前不能处理的。令人惊讶的是(可能是因为时间维度的大小为1)，netCDF-Java和NcML可以在这里通过向NcML添加logicalReduce元素再次完成这项工作：

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<ncml:netcdf xmlns:ncml="http://www.unidata.ucar.edu/namespaces/netcdf/ncml-2.2" location="/path_to_file/processed_LIS_HIST_201908010000.d01.nc">
  <ncml:variable name="ensemble">
    <ncml:attribute name="_CoordinateAxisType" value="Ensemble" />
    <ncml:logicalReduce dimNames="time" />
  </ncml:variable>
</ncml:netcdf>

此时，netCDF-Java将能够完全识别示例数据集中的网格。