R-Markdown不再编织

Question

在过去的几年里，我用我的笔记在R上创建了一个广泛的markdown文件。今天，它不再正确编织，备份版本也没有正确编织。输出是正确输出和代码列表之间的交叉点；有时会以##为前缀。

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title: 'The R Companion'
fontsize: 11pt
toc: true
toc_depth: 4
geometry: "top = 2cm, bottom = 1.5cm, left = 2cm, right = 1.5cm"
output: pdf_document

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\pagebreak

```{r setup, include=FALSE}

knitr::opts_chunk$set(echo =真)

knitr::opts_chunk$set(tidy.opts=list(width.cutoff=60)，tidy=TRUE)

knitr::opts_chunk$set(fig.height = 3.5，fig.width = 7)

库(Readr)

库(Ggplot2)

库(Knitr)

库(KableExtra)

库(Lubridate)

库(Dplyr)

库(Tibble)

库(Ggthemes)

库(RColorBrewer)

###Basic Data Manipulation

####Vector creation 
```{r}

A <- 1:5

B <- 6:10

C <- append(a，b)

打印(C)

追加到c4之后。

追加(c，4.5，after=4)

在c之前追加。

追加(c，c(-1，0)，after = 0)

输出(如下)只有15个目录列表中的两个，标题尚未编织，并且输出不完整/错误。RStudio 1.2.1335，R 3.6.0.，Rmarkdown 1.12.谢谢。

The R Companion
Contents
Creating and tidying data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 GraphicsI:Plot,axes,titleandlegend. .............................. 20
1
###Basic Data Manipulation ####Vector creation
## [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 910
##  [1]  1.0  2.0  3.0  4.0  4.5  5.0  6.0  7.0  8.0  9.0 10.0
##  [1] -1  0  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10   

Answer 1

尝试安装formatR包。直到我安装了它，它才对我起作用。我刚刚运行了你的代码，这是我得到的文档文档的输出。这就是你要找的东西吗？

The R Companion

Basic Data Manipulation
Vector creation
a <- 1:5
b <- 6:10
c <- append(a, b)
print(c)
##  [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10
# Append after c[4].
append(c, 4.5, after = 4)
##  [1]  1.0  2.0  3.0  4.0  4.5  5.0  6.0  7.0  8.0  9.0 10.0
# Append before c[0].
append(c, c(-1, 0), after = 0)
##  [1] -1  0  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10