如何使用nilearn和matplotlib子图绘制3D大脑图像的多个切片

Question

我是编程新手，所以如果我完全错了，请告诉我。

我想用尼勒恩绘制25张脑部扫描图。这25个切片应该以value=2的步长沿着z轴移动。我想使用子图来表示它们。

这是我到目前为止所知道的：

cuts = np.arange(-25,25,2)
fig, (axes1,axes2,axes3,axes4,axes5) = plt.subplots(5,1, figsize=(10,10))

for axes in [axes1,axes2,axes3,axes4,axes5]:
    for slc in cuts:
        plotting.plot_stat_map(rsn_four, display_mode='z', axes=axes, cut_coords=[slc], threshold=2)
plt.show()

'rsn_four‘是一个粗体扫描的3DNIFTI文件。

Output:

我认为我最大的问题之一是，我不知道如何实现，每个轴我想要np.arange()的5个值，然后将它带到下一个轴，继续计数。

如果我错过了一些信息，请告诉我，这是我在这里的第一个帖子！

Answer 1

在这里，内置的enumerate可能有助于您仅从每个图像所需的裁剪中获取正确的索引

cuts = np.arange(-25,25,2)
fig, (axes1,axes2,axes3,axes4,axes5) = plt.subplots(5,1, figsize=(10,10))

for num, axes in enumerate([axes1,axes2,axes3,axes4,axes5]):
    for slc in cuts[num:num+5]:
        plotting.plot_stat_map(rsn_four, display_mode='z', axes=axes, cut_coords=[slc], threshold=2)
plt.show()