安装factoextra时rbind(info，getNamespaceInfo(env，"S3methods"))出错

Question

我正在尝试使用Windows上的本地源码tar ball安装"factoextra“包。我可以用同样的方式安装其他包，没有问题。然而，当安装"factoextra“时，我得到了一个与S3methods相关的错误。

我已经尝试使用本地windows二进制文件，安装了最新的Rtools，并确保安装了所有依赖项。我还尝试使用该包的归档版本。

install.packages('D:\\R_Packages\\Packages\\factoextra_1.0.5.tar.gz', repos = NULL, type="source")

* installing *source* package 'factoextra' ...
** package 'factoextra' successfully unpacked and MD5 sums checked
** R
** data
*** moving datasets to lazyload DB
** byte-compile and prepare package for lazy loading
Error in rbind(info, getNamespaceInfo(env, "S3methods")) : 
  number of columns of matrices must match (see arg 2)
ERROR: lazy loading failed for package 'factoextra'
* removing 'D:/R-3.5.2/library/factoextra'
In R CMD INSTALL
Warning in install.packages :
   installation of package ‘D:/R_Packages/Packages/factoextra_1.0.5.tar.gz’ had non-zero exit status

我真的只需要安装这个包。

Answer 1

我找到了这个帖子：http://r.789695.n4.nabble.com/Error-in-rbind-info-getNamespaceInfo-env-quot-S3methods-quot-td4755490.html，它引导我找到了如何在我的机器上解决类似问题的方法。

我发现我的系统上安装了一个损坏的软件包版本，必须手动删除它才能安装干净的版本。

查找factoextra是否安装以及安装位置(它可能在您的系统上，只是过时或损坏)：

find.package("factoextra")

如果它已经存在(只是坏了)，你可以尝试用以下命令删除它：

remove.packages("factoextra")

如果在find.packages()提示软件包已经存在的情况下remove.packages()仍然失败，那么可以使用find.packages()返回的路径来使用操作系统的文件系统来查找和删除软件包--只需小心删除您知道损坏的内容即可。

一旦旧的、损坏的包被移除，使用install.packages("factoextra")，它应该可以工作。

我有几个包都是这样坏掉的。如果您遇到这种情况，您可以使用以下命令来确定要删除和安装的软件包：

allPackages <- installed.packages()[, 1]
findBrokenPackages <- function(packages) {
    for (p in packages) {
        tryCatch(ncol(asNamespace(p)$.__NAMESPACE__.$S3methods),
                 error = function(e) print(c(p, e)))
    }
}
findBrokenPackages(allPackages)

这将打印出有相同问题的所有软件包。我建议在再次尝试使用install.packages()之前删除所有损坏的包。