获取RStudio服务器开放源码版本以使用备用的gcc版本

Question

我在一台RHEL7机器上安装了RStudio服务器的开源版本。因为我需要安装的R包需要比所提供的版本(4.8.5)更新的gcc/g++版本，所以我已经通过Red Hat Developer Toolset安装了5.3.1。

我一直无法让RStudio服务器使用较新的gcc版本。我尝试将source scl_source enable devtoolset-4附加到.bash_profile的末尾，并设置CC, CXX和COLLECT_LTD_WRAPPER环境。我的主目录中的Makevars文件以及$R_ home /etc/Renviron.site .site文件中的变量。在RStudio服务器上运行system("gcc -v")仍然说，gcc的版本是4.8.5。但是，如果ssh进入服务器并从那里运行R，然后检查gcc的版本，它使用的是正确的版本(5.3.1)。

如何让RStudio Server中的R会话使用更新的GCC版本？

Answer 1

将包含新版本的gcc bin的PATH变量放在$R_HOME/etc/Renviron.site中，如下所示。

PATH=/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin:/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin

然后进行全局设置

您也可以在R-studio中为每个会话设置它

Sys.setenv("PATH"="/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin:/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin")

Answer 2

安装devtoolset。

yum install centos-release-scl
yum install devtoolset-8-gcc devtoolset-8-gcc-c++

将以下内容添加到~/.R/Makevars中。

CC=/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin/gcc
CXX=/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin/g++ -std=c++11
CXX11=/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin/g++ -std=c++11
CXX14=/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin/g++ -std=c++1y
CXX14FLAGS=-O3 -march=native -mtune=native -fPIC