如何指定内核，同时执行一个Jupyter笔记本时，使用造纸厂的Python客户端？

Question

我正在运行一个jupyter notebook脚本，使用的是Papermill的python客户端。在运行时，我想指定内核。但是，该脚本运行在与我的活动python shell相同的内核中(通过它，我对papermill进行了API调用，以便运行笔记本的脚本)。

我尝试在文档(https://papermill.readthedocs.io/en/latest/usage-execute.html#execute-via-the-python-api)中查找，但徒劳无功。

import papermill as pm
pm.execute_notebook( 'dfnjofnei.ipynb', 'dfnjofnei_output.ipynb' )

Answer 1

不确定这是否为时过晚，但您可以查看以下内容：

papermill {input_path} {output_path} -k {kernel_name}

Answer 2

文档并不全面。您可以在此处找到其他可配置的参数：https://github.com/nteract/papermill/blob/main/papermill/execute.py

要在调用接口时指定内核，只需提供kernel_name，例如：

import papermill as pm
pm.execute_notebook(
    'input.ipynb',
    kernel_name='python3'
)

(我试过了，效果很好)

Answer 3

使用pipenv管理虚拟环境，并围绕您正在使用的任何工具构建内核。

首先，确保您安装了pipenv。然后，您可以使用以下命令轻松地创建一个新的pipenv和ipython内核

$ pipenv [--two|--three] install ipykernel

一旦创建了ipykernel，就需要安装它：

$ pipenv run python -m ipykernel install --user --name=My_Project_Name"

将您想要的任何其他pip模块添加到venv：

$ pipenv install module_name

启动Jupyter Notebook并从下拉菜单中选择您的内核。

您现在可以随意添加模块，无需重启内核即可使用这些模块。

为了使这个过程更简单，我创建了一个小工具，它可以从命令行自动创建pipenv环境。它还有助于删除未使用的内核。您可以找到它的here，以及一个脚本来剥离任何notebook %magic，并将ipynotebook转换为可运行的python脚本。

用法：

# create a python 3 virtualenv and add the kernel to ipython
$ mkdir MyProject
$ cd MyProject
$ pipenv_jupyter.sh -3
# remove an unwanted kernel
$ pipenv_jupyter.sh -c