使用pynco包压缩netCDF文件

Question

我对使用pynco包在python中压缩NetCDF文件很感兴趣。在NCO中，我会使用：

nccopy -d 3 input_file.nc output_file.nc

在python中，我尝试了以下操作：

from nco import Nco
Nco.nccopy(input='input_file.nc', output='output_file.nc', options=['-d 1'])

这会产生一个属性错误'Nco' has no attribute 'nccopy'。pynco中是否支持nccopy

Answer 1

nccopy是netCDF命令，而不是NCO命令。然而，ncks几乎可以做nccopy做的所有事情，还有很多其他的事情。要像您的示例中那样压缩，请尝试

Nco.ncks(input='input_file.nc', output='output_file.nc', options=['-7 -L 1'])

Answer 2

仅列出pynco的一个替代方案，您也可以使用cdo包在python中执行此操作：

from cdo import *
cdo = Cdo()
cdo.copy(input='input.nc',output='output.nc',options='-f nc4 -z zip_7')

你可以选择从轻量级(zip_1)到最高压缩级(zip_9)的压缩级别，我通常会发现超过4级或5级的压缩级别不会有太大的收益(即额外节省的大小非常小)，因为很多痛苦(命令需要更长的时间！)。我认为如果输入是netCDF4标准的，那么确保netCDF4输出的-f nc4可能就不需要了，但无论如何也没什么坏处。

您可以使用以下命令安装cdo

pip3 install cdo