我试过运行ONT basecaller孔雀鱼。我之前已经多次运行过这段代码,没有任何问题。现在(在重新启动之后)它产生了错误消息:
[guppy/error] main: CUDA error at /builds/ofan/ont_core_cpp/ont_core/common/cuda_common.cpp:203: CUDA_ERROR_COMPAT_NOT_SUPPORTED_ON_DEVICE [guppy/warning] main: An error occurred in the basecaller. Aborting.
这是一个兼容性问题吗?如果是的话,我可以做些什么来解决它?我使用的是Ubuntu18.04.4LTS(GNU/Linux5.4.0-72-generic x86_64)和Guppy Basecalling,(C)牛津纳米孔技术有限公司。版本4.0.14+8d3226e,客户端-服务器应用编程接口版本2.1.0
这是我的孔雀鱼代码:
guppy_basecaller -i fast5/pass -r --device cuda:0 -s hac_fastqs_demul -c /opt/ont/ont-guppy/data/dna_r9.4.1_450bps_hac.cfg --num_callers 4 --require_barcodes_both_ends --trim_barcodes --detect_mid_strand_barcodes --barcode_kits "EXP-PBC001"
发布于 2021-04-26 17:55:53
此问题已通过重新启动修复。
https://stackoverflow.com/questions/67263721
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