我正在尝试用山脊图可视化一些数据,但我想知道是否有一种方法可以加权山脊的密度。
基本上,我有以下几点:
set.seed(1)
example <- data.frame(matrix(nrow=100,ncol=3))
colnames(example) <- c("year","position","weight")
example$year <- as.character(rep(c(1,2,3,4,5),each=20) )
example$position <- runif(100,1,10)
example$weight <- sample(1:3,100,replace = T)5个不同年份的职位样本。我想用山脊图绘制分布随时间的变化,但在数据集中,还有一个“权重”列,这意味着一些样本比其他样本更重要。有没有办法把它合并到我的山脊分布图中?还有,有没有一种方法可以让具有较多样本*权重的行比具有较少样本*权重的行更高?那么,不是将每年的身高正常化为1吗?
ggplot(example,aes(x=position,y=year))+
ggridges::geom_density_ridges()+
theme_classic()我在想,我可以尝试通过管道传输数据集来重复它们拥有的权重值的行数,这样它们就会被计数超过x次(或“权重”次数),并改变密度。不过,我不太明白该怎么做。另外,在我的数据集中,权重不是整数,所以我希望有一个更好的解决方案。
或者,有没有其他包/技术可以实现这一点?
发布于 2020-01-21 06:39:36
对于这个数据集,我们可以重复基于weight列的行,然后绘制:
library(ggplot2)
library(ggridges)
example2 <- example[rep(seq_along(example$weight), example$weight), ]
ggplot(example2,aes(x=position,y=year))+
ggridges::geom_density_ridges()+
theme_classic()
#> Picking joint bandwidth of 1.02

但是,如果您的wight不是整数,这将不起作用。有一个this open issue on github,你可能想试一试。
另一个想法是将原始数据集中的权重归一化为整数,方法是将它们舍入到某些数字,然后将它们乘以10,使其成为所需精度的幂。然后,您可以将先前的解决方案用于您的实际数据集。
https://stackoverflow.com/questions/59831248
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