警告:因子包含隐式NA

Question

我是R和Shiny的新手，我正在尝试用ggplot2创建一个交互式的情节。当用户选中该复选框时，他可以访问多选字段以自定义绘图。

原始数据帧包含在Publisher和Year列中标识为"N/A"的缺失值。我用complete.cases删除了包含NAs的行，所以它应该不会有任何NA了。

我运行我的应用程序:好的。我得到了默认的图: OK。我选中了复选框：Warning: Factor 'Publisher' contains implicit NA, consider using 'forcats::fct_explicit_na'

我想删除这个警告，至少要理解它。如果你有任何额外的意见，请这样做:我的目标是变得更好。

app.R：

df<-read.csv("vgsales.csv")
df$Year[df$Year=="N/A"]<-NA
df$Year<-factor(df$Year)
df$Publisher[df$Publisher=="N/A"]<-NA
df$Publisher<-factor(df$Publisher)
df<-df[complete.cases(df),]

pubSales<-na.omit(df
    %>% group_by(Publisher, Year) 
    %>% summarise(Global_Sales=sum(Global_Sales))
)
pubSales<-pubSales[order(pubSales$Year),]

top5Pub<-head(unique(pubSales[order(-pubSales$Global_Sales),]$Publisher),5)

ui <- navbarPage("Video Games Sales",
    tabPanel("Publishers",
        mainPanel(
            titlePanel(
                title = "Publishers sales"
            ),
            sidebarPanel(
                radioButtons(
                    "pubOptions",
                    "Options",
                    c("Top 5 Publishers"="topFivePub",
                      "Custom Publishers"="customPub"),
                    selected="topFivePub"
                ),
                uiOutput("customPubUI")
            ),
            mainPanel(
                plotOutput("pubPlot")
            ),
            width=12
        )
    )
)

server <- function(input, output, session) {

    output$customPubUI<-renderUI({
        if(input$pubOptions=="customPub"){
            selectInput(
                "selectedPub",
                "Editeurs",
                pubSales$Publisher,
                multiple=TRUE
            )
        }
    })

    output$pubSales<-renderTable(pubSales)
    output$pubPlot<-renderPlot({
        ggplot()+
            if(input$pubOptions=="customPub"){
                geom_line(
                    data=pubSales[pubSales$Publisher %in% input$selectedPub,],
                    aes(x=Year,y=Global_Sales,colour=Publisher,group=Publisher)
                )
            }else{
                geom_line(
                    data=pubSales[pubSales$Publisher %in% top5Pub,],
                    aes(x=Year,y=Global_Sales,colour=Publisher,group=Publisher)
                )
            }
    })

}

shinyApp(ui, server)

Answer 1

通过以下方式：

require(shiny)
require(tidyverse)

# Create some sample data:
year <- rep(2000:2018, each=3)

publ <- rep(strrep(c("Pub 1", "Pub2", "pub3"), 1), 19)

Global_Sales <- rep(sample(1:100,19),3)
# Create a observation with NA:
newline <- c(NA, NA, 33)

df <- data.frame(Year = year, Publisher = publ, Global_Sales = Global_Sales)
df <- rbind(df,newline)
df <- na.omit(df)

pubSales<-df %>%  group_by(Publisher, Year)  %>%
  summarise(Global_Sales=sum(Global_Sales)) 

pubSales$Publisher <- as.character(pubSales$Publisher) 

错误不再出现。只要您在shiny中处理的数据不包含因子(这就是“隐式NA”的来源)，错误就不会出现在我的样本数据中。

Answer 2

弹出警告是因为NA不是因子中的一个级别。它就是缺失了。该警告提醒您，当您对该因子执行操作时，该因子中存在一个不会显示的“隐藏”级别。

例如，一个基本因子：

a.factor <- as.factor(c('a', 'b', 'c', NA))

当我们打印它或在快捷表中总结时，只有3个级别：

> print(a.factor)
[1] a    b    c    <NA>
Levels: a b c

> table(a.factor)
a.factor
a b c 
1 1 1 

Answer 3

如果您的数据帧包含未使用的因子级别，我使用

pubSales <- droplevels(pubSales)

这将为我删除未使用的级别和错误。