如何从我在RStudio中运行的脚本中获得所有输出

Question

我希望看到一个149行的脚本的输出。在整个脚本过程中，都有我想要查看的表。我使用的是RStudio集成开发环境。在过去，我使用过Tinn-R。我将运行整个脚本，代码行和打印的对象将在控制台中可见。

例如，下面是一段摘录

attach(uniquehuman.race.eth)
partA.eth <-table(Ethnicity, Sex,useNA="ifany")
partA.eth
margin.table(partA.eth,1)#row totals
margin.table(partA.eth,2)#column totals
nrow(uniquehuman.race.eth)#total logged in

上面的代码将给出表格和我需要的数字的文本输出。然后，我可以保存控制台或将整个内容复制并粘贴到文本文件中。

我如何在RStudio中做到这一点？最接近它的是在每一行上按CTRL-ENTER，但我不想这样做149次。如果我按CTRL-SHIFT-ENTER组合键"run all"，那么R将处理所有数据并将对象放入内存，但我看不到输出。

请告诉我如何查看所有输出和/或将输出发送到文本文件。

Answer 1

我是RStudio开发人员之一。谢谢你的反馈--我会记录一个bug。

同时，一种解决方法是从控制台执行source(filename, echo=T)。

Answer 2

您可以简单地选择要运行的代码，然后按CTRL+ENTER键在RStudio中执行您想要的操作。这适用于多行，与Tinn-R中的完全一样。如果你想以一种详细的方式一次运行所有的东西，你可以按CTRL-A CTRL-ENTER。

作为另一个保存到文本文件的选项，您可以检查?sink：

sink(file='path/to/somefile.ext')
... # the code generating output
sink()

sink()将控制台的所有输出重定向到一个连接，在本例中是某个文件。请注意，这只是标准输出，而不是警告或错误。此命令在与print()、cat()、sprintf()等结合使用时，在分析中创建输出文件时也很方便。

如果在RStudio中使用"run all“，则必须显式地使用所提到的任何函数来生成文件的输出。原则上，如果您运行整个脚本，RStudio将以静默方式运行。

Answer 3

使用选项(verbose=TRUE)在整个脚本或会话中详细打印所有输出。