在HPC集群中运行Vasp作业

Question

使用pyiron，我构建了我的脚本，并将其提交到集群中运行，我想知道如何才能做到这一点？

注意: Vasp已经安装在my Cluster中。

Answer 1

pyiron使用pysqa将作业提交到队列系统：https://github.com/pyiron/pysqa，示例队列配置可在https://github.com/pyiron/pysqa/tree/master/tests/config上找到，因此在pyiron资源目录中，您可以创建一个名为queues的文件夹，其中包含pysqa队列系统配置。

完成此操作后，您可以使用：

job.server.list_queues()

要查看可用队列和：

job.server.view_queues()

要获取有关单个队列的详细信息并最终使用以下命令提交作业，请执行以下操作：

job.server.queue = 'queue_name'

其中queue_name是要选择的队列的名称，然后使用以下命令指定cores和run_time：

job.server.cores = 8 
job.server.run_time = 30000

最后，当您调用job.run()时，它会自动提交到队列。