如何在AWS linux操作系统中安装trimmomatic、bowtie2、samtools、seqtk等生物信息库？

Question

我找不到一种方法在基于AWS linux的操作系统中安装Bioinformatics和其他受支持的软件包，而这些软件包在ubuntu中工作，他们的文档显示它们支持基于linux的操作系统。有什么命令可以解决这个问题吗？

Answer 1

使用conda安装许多常用的生物信息学软件包。例如:使用conda install seqtk或conda create --name seqtk seqtk安装seqtk包。

Answer 2

这款docker container拥有您所需的大多数生物信息学软件。您可以获取镜像并在运行的容器中工作。如果你还不习惯使用Docker容器，你可以去每个软件自己的网站，根据他们的建议下载它。