在果园试验中,共设5个处理和5个小区。为了分析这些处理对树木和果实生长的影响,在中间树排的两边的处理都是相同的。我如何随机化R中的治疗,而不使一个块的最后一个处理与下一个块的开始处理相同。例如,我使用agricolae软件包对其区块内的治疗进行随机化,但我得到的随机化如下:
Block 1: 3 1 5 2 4
Block 2: 2 3 4 5 1
Block 3: 2 5 1 4 3
Block 4: 1 5 3 4 2
Block 5: 2 3 1 5 4正如你所看到的,块4以处理2结束,然后块5以2开始。如果可能的话,我想避免这种情况,但我不确定如何在r中做到这一点。
实验的可视化表示,在他们的图中没有随机化的处理:

运行下面的解决方案,我遇到了新表没有显示数字的问题。
发布于 2021-02-10 23:27:31
假设你有这样的数据:
head(data,10)
# Block TreeMiddleRow
#1 Block 1 Treatment 1
#2 Block 1 Treatment 2
#3 Block 1 Treatment 3
#4 Block 1 Treatment 4
#5 Block 1 Treatment 5
#6 Block 2 Treatment 1
#7 Block 2 Treatment 2
#8 Block 2 Treatment 3
#9 Block 2 Treatment 4
#10 Block 2 Treatment 5可以使用while循环继续按组重采样,直到所有块边界都不相等为止:
treatments <- rep("Tretment",nrow(data))
while(any(treatments[head(cumsum(rle(data$Block)$lengths),-1)] == treatments[head(cumsum(rle(data$Block)$lengths),-1)+1])){
treatments <<- unname(unlist(tapply(data$TreeMiddleRow,
data$Block,
FUN = function(x) sample(x,size = 5, replace = FALSE))))
}
data$TreeMiddleRow <- treatments
head(data,10)
# Block TreeMiddleRow
#1 Block 1 Treatment 2
#2 Block 1 Treatment 3
#3 Block 1 Treatment 4
#4 Block 1 Treatment 5
#5 Block 1 Treatment 1
#6 Block 2 Treatment 2
#7 Block 2 Treatment 5
#8 Block 2 Treatment 3
#9 Block 2 Treatment 4
#10 Block 2 Treatment 1请注意,带有rle的cumsum允许我们返回块之间边界的索引。head(x,-1)删除了最后一个,因为我们并不关心它:
head(cumsum(rle(data$Block)$lengths),-1)
#[1] 5 10 15 20示例数据:
data <- data.frame(Block = rep(paste("Block",1:5),each = 5),
TreeMiddleRow = rep(paste("Treatment",1:5),times = 5))https://stackoverflow.com/questions/66139428
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