未找到blastn + google协作

Question

如何解决此问题：

ApplicationError:来自'blastn -out /content/output/kitasatospora/out.txt -outfmt 6 -query /content/sequence_USA_utah.fasta -subject /content/sequence_USA_utah.fasta'，message '/bin/sh: 1: blastn: not found‘的非零返回代码127

Answer 1

您需要先安装它。

!apt install ncbi-blast+

然后，您可以运行blastn。