假设我想要获得一个lmer对象中每一项的某种效果大小,最好的方法是什么?例如,我有一个具有两个主效果(gen和nutrient)及其交互的模型:
library(lme4)
data(Arabidopsis)
fit1 <- lmer(total.fruits~gen*nutrient+(1|reg), data=Arabidopsis)
summary(fit1)
# # # truncated output
Random effects:
Groups Name Variance Std.Dev.
reg (Intercept) 144.4 12.02
Residual 1304.4 36.12
Number of obs: 625, groups: reg, 3
Fixed effects:
Estimate Std. Error df t value Pr(>|t|)
(Intercept) 4.35938 10.72391 7.20000 0.407 0.696
gen 0.13441 0.39560 67.90000 0.340 0.735
nutrient 6.62369 0.99266 619.40000 6.673 5.58e-11 ***
gen:nutrient -0.09971 0.04308 619.50000 -2.314 0.021 *
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1如果我想获得每个固定效果主效和交互作用项的效果大小(R2或伪R2),最好的方法是什么?获取完整模型(如MuMIn::r.squaredGLMM(fit1))的R2,并在构建最终模型时使用模型比较方法?还是有更好的方法?
https://stackoverflow.com/questions/44558006
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