我有一个包含gzipped数据文件的目录。我想使用脚本est_abundance.py运行每个文件。但首先我需要解开拉链。所以我有了这个狂欢:
for file in /home/doy.user/scratch1/Secoutput/; do
cd "$file"
gunzip *kren.gz
python analysis1.py -i /Secoutput/*kren -k gkd_output -o /bracken_output/$(basename *kren).txt
wait
done问题是,bash脚本一直在解压缩所有的数据文件,在解压缩一个文件后,它不会继续执行下一个命令。你能帮我纠正这个错误吗?我只想为每个文件执行所有命令。
https://stackoverflow.com/questions/38239794
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