在R树状图中，如何减少树叶长度来拟合标签？

Question

我用hcluster生成了一个集群。original dendogram。

出于格式化目的，我使用了as.dendogram。当我这样做的时候，我的标签被剪掉了。vertical dendogram

更多的是通过水平方向。这就是我需要的。horizontal dendogram

这个问题看起来不像是在边距上，因为(对于水平的)我使用了没有标签效果的par(oma = c(0, 0, 0, 8)。这只会减少我的边际空间，但不会给标签名称留出更多空间。如何确保绘图显示整个型号名称？

Answer 1

您可能应该在par()中更改mar而不是oma

mm <- matrix(rnorm(20), ncol = 4)
colnames(mm) <- c("leaf1", "leaf2", "leaf3", "very_long_leaf_realy")

# compare:
plot(as.dendrogram(hclust(dist(t(mm)))), horiz = TRUE)

# with:
oldpar <- par(mar = c(5, 4 ,4 , 8))
plot(as.dendrogram(hclust(dist(t(mm)))), horiz = TRUE)
par(oldpar) # restoring ploting parameters