PETSc矩阵复制引发异常:为什么？

Question

我正在使用petsc4py，却得到了一个我不理解的异常。我定义了以下函数：

def tsIJacobian(self, ts, t, u, udot, shift, A, B):
    self.setup_problem()
    psol = fe.as_backend_type(self.sol.vector()).vec()
    pA = fe.as_backend_type(self.A).mat()
    u.copy(psol)
    JU = fe.assemble(fe.derivative(ksdg.U_terms, ksdg.U))
    Jrho = fe.assemble(fe.derivative(ksdg.rho_terms, ksdg.rho))
    pJU = fe.as_backend_type(JU).mat()
    pJrho = fe.as_backend_type(Jrho).mat()
    pA.copy(A)
    A.scale(shift)
    A.axpy(1.0, pJU)
    A.axpy(1.0, pJrho)
    A.assemble()
    if not (A is B):
        A.copy(B)
        B.assemble()

然后尝试以下操作。(pA已经在其他地方定义为48x48 PETSc.Mat，并进行了组装。ksdg是我正在处理的一个类的实例，如果我能让它工作，这最终将成为它的成员函数)：

J = pA.duplicate()
B = pA.duplicate()
tsIJacobian(ksdg, ts, 0, psol, pdsol, 0.1, J, B)

这将引发以下异常：

---------------------------------------------------------------------------
Error                                     Traceback (most recent call last)
<ipython-input-24-2a71f7ccf0af> in <module>()
----> 1 tsIJacobian(ksdg, ts, 0, psol, pdsol, 0.1, J, B)

<ipython-input-22-14579c08d6ae> in tsIJacobian(self, ts, t, u, udot, shift, A, B)
     15     A.assemble()
     16     if not (A is B):
---> 17         A.copy(B)
     18         B.assemble()

PETSc/Mat.pyx in petsc4py.PETSc.Mat.copy (src/petsc4py.PETSc.c:118071)()

Error: error code 63

看看petscerror.h.html，63岁的人是PETSC_ERR_ARG_OUTOFRANGE 63 /* input argument, out of range */。

如果有人理解为什么PETSc不允许我将矩阵A复制到B，我将不胜感激。谢谢。

Answer 1

好了，我已经有点明白了。当用户尝试在稀疏矩阵中创建新的非零元素时，如果选项

PETSc.Mat.Option.NEW_NONZERO_ALLOCATION_ERR

是True。因此，如果我执行

B.setOption(PETSc.Mat.Option.NEW_NONZERO_ALLOCATION_ERR, False)

在创建B之后，tsIJacobian中不会立即引发任何异常。我不明白的是，为什么我不能为J获得相同的异常。