使用tidygraph生成的列表列重塑数据帧

Question

我正在使用tidygraph包，并尝试为下面的示例找到一个“整洁”的解决方案。这个问题并不是真的与tidygraph有关，而是更多地与数据争论有关，但我认为这对使用这个包的人来说很有趣。

在下面的代码块中，我只生成了一些示例数据。

library(tidyverse)
library(tidygraph)
library(igraph)
library(randomNames)
library(reshape2)

graph <- play_smallworld(1, 100, 3, 0.05) 

labeled_graph <- graph %>% 
                    activate(nodes) %>%
                    mutate(group = sample(letters[1:3], size = 100, replace = TRUE),
                           name = randomNames(100)
                           )

sub_graphs_df <- labeled_graph %>% 
                    morph(to_split, group) %>%
                    crystallise()

生成的data.frame如下所示：

sub_graphs_df
# A tibble: 3 x 2
      name           graph
     <chr>          <list>
1 group: a <S3: tbl_graph>
2 group: b <S3: tbl_graph>
3 group: c <S3: tbl_graph>

现在来看我的实际问题。我想对列graph中的每个元素应用一个函数。结果就是一个简单的命名向量。

sub_graphs_df$graph %>% map(degree)

我不喜欢的第一件事是$的子集。有没有更好的方法？

接下来，我想将这个结果重塑为一个包含3列的data.frame。一列用于name (向量的名称属性)，一列用于group (列表的名称属性)，另一列用于number (向量的元素)。

我尝试了reshape2包中的melt。

sub_graphs_df$graph %>% map(degree) %>% melt

它工作得很好，但是名称丢失了，在我阅读它的时候，应该使用tidyr。但是，我无法让gather工作，因为只接受data.frames。

另一种选择是unlist：

sub_graphs_df$graph %>% map(degree) %>% unlist

在这里，组和名称在名称属性中，我必须用正则表达式恢复它们。

我很确定有一种我想不到的简单方法。

Answer 1

我们可以使用mutate创建一个list列，同时使用map应用函数，提取names和integer以及unnest以创建'long‘格式的数据集

sub_graphs_df %>%
   mutate(newout = map(graph, degree)) %>%
   transmute(name, group = map(newout, ~.x %>% names), number = map(newout, as.integer)) %>%
    unnest
# A tibble: 100 x 3
#   name     group              number
#   <chr>    <chr>               <int>
# 1 group: a Seng, Trevor            0
# 2 group: a Buccieri, Joshua        1
# 3 group: a Street, Aimee           2
# 4 group: a Gonzalez, Corey         2
# 5 group: a Barber, Monique         1
# 6 group: a Doan, Christina         1
# 7 group: a Ninomiya, Janna         1
# 8 group: a Bazemore, Chao          1
# 9 group: a Perfecto, Jennifer      1
#10 group: a Lopez Jr, Vinette       0
# ... with 90 more rows