这些点可以根据R metafor包中的类别在L‘’abbé-plot中着色吗？

Question

有没有可能给L‘’abbé图中的“点”上色？我正在使用metafor包。

 # Load package
 library(metafor)

 # Load data
 data(dat.bcg)

 # Code 
 ex <- rma(ai=tpos, bi=tneg, ci=cpos, 
 di=cneg, data=dat.bcg, measure="OR",
 slab=paste(author, year, sep=", "), method="FE")

# L'abbé plot
labbe(ex, transf = exp, ylab="Test group", xlab="Control")

是否可以根据变量对这些点进行着色？

Fx蓝色点，表示：

dat.bcg$alloc==random

谢谢你C。

Answer 1

您可以尝试执行以下操作：

dat.bcg$var[dat.bcg$alloc == "random"] <- "blue"

labbe(ex, transf = exp, ylab = "Test group", xlab = "Control", bg = dat.bcg$var)

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如果不进行转换：

labbe(ex, ylab = "Test group", xlab = "Control", bg = dat.bcg$var, grid = TRUE)

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我们可以看到，dat.bcg$alloc == "random"的7个实例有7个蓝点。

区分这些点的另一个选项：

labbe(ex, ylab = "Test group", xlab = "Control", grid = TRUE, pch = dat.bcg$alloc)

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要更改所有三个点的颜色，可以执行以下操作：

dat.bcg$var[dat.bcg$alloc == "random"] <- "blue"
dat.bcg$var[dat.bcg$alloc == "alternate"] <- "green"
dat.bcg$var[dat.bcg$alloc == "systematic"] <- "red"

或者，对于dplyr，我们可以使用case_when

library(dplyr)

dat.bcg <- dat.bcg %>% 
  mutate(var = case_when(alloc == "random" ~ "blue",
                         alloc == "alternate" ~ "green",
                         alloc == "systematic" ~ "red",
                         TRUE ~ as.character(NA)))

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