在docker镜像中安装R

Question

如何在docker镜像中安装R版本3.4.0。我已经使用以下命令安装了python：

RUN yum -y install https://centos6.iuscommunity.org/ius-release.rpm \
  && yum -y install python36u \
  && yum -y install python36u-devel \
  && yum -y install python36u-pip \
  && yum -y install python36u-tkinter.x86_64

同样，我需要安装R：

到目前为止，我已经在文件中为R指定了以下内容：

ENV R_BASE_VERSION 3.4.0
RUN Rscript -e 'install.packages("devtools",dependencies=TRUE)' \
    &&Rscript -e 'install.packages("methods",dependencies=TRUE)' \
    &&Rscript -e 'install.packages("jsonlite",dependencies=TRUE)' \

请推荐，我是码头新手

我想我需要做一些如下的事情：

ENV R_BASE_VERSION 3.4.1

## Now install R and littler, and create a link for littler in /usr/local/bin
## Also set a default CRAN repo, and make sure littler knows about it too
RUN apt-get update \
    && apt-get install -t unstable -y --no-install-recommends \
        littler \
                r-cran-littler \
        r-base=${R_BASE_VERSION}* \
        r-base-dev=${R_BASE_VERSION}* \
        r-recommended=${R_BASE_VERSION}* \
        && echo 'options(repos = c(CRAN = "https://cran.rstudio.com/"), download.file.method = "libcurl")' >> /etc/R/Rprofile.site \
        && echo 'source("/etc/R/Rprofile.site")' >> /etc/littler.r \
    && ln -s /usr/share/doc/littler/examples/install.r /usr/local/bin/install.r \
    && ln -s /usr/share/doc/littler/examples/install2.r /usr/local/bin/install2.r \
    && ln -s /usr/share/doc/littler/examples/installGithub.r /usr/local/bin/installGithub.r \
    && ln -s /usr/share/doc/littler/examples/testInstalled.r /usr/local/bin/testInstalled.r \
    && install.r docopt \
    && rm -rf /tmp/downloaded_packages/ /tmp/*.rds \
    && rm -rf /var/lib/apt/lists/*

但我不知道这些垃圾到底是什么。我只需要安装R，然后我将按照上面指定的那样安装所需的包。

编辑:我的docker文件的第一行安装了node4。

Answer 1

下面是两个用于安装Python和NodeJS的DockerFile

第一个安装Python 3.4.2、R 3.1.1和nodejs 4.8.4：

From node:4
RUN apt-get update && apt-get remove -y python && apt-get install -y python3 r-base
RUN cp /usr/bin/python3 /usr/bin/python

第二个安装Python 3.5.3、R 3.4.1和nodejs 4.8.4：

From r-base:3.4.1
RUN apt-get update && apt-get install -y python3 nodejs
RUN cp /usr/bin/python3 /usr/bin/python

选择一个最适合你的需求。

Answer 2

如果您的公共基础镜像(您自己的镜像的基础镜像)实际上是node:4，那么它不是基于yum，而是基于apt-get来管理包。

因此，您应该通过以下方式安装R：

RUN apt-get update && apt-get install -y r-base

Answer 3

您应该使用一些R图像，例如

https://hub.docker.com/_/r-base/

或此列表中的某个oher图像

https://hub.docker.com/search/?isAutomated=0&isOfficial=0&page=1&pullCount=0&q=R&starCount=0