shinyapp的Dockerfile

Question

我正在尝试为一个闪亮的应用程序构建一个Dockerfile。正在使用的包: shiny、ggplot2。应用程序(app.R)将使用以下命令"Rscript app_run.R“通过app_run.R文件运行。

我使用了一个摇杆容器，但我认为这个容器已经安装了各种各样的包。有人知道如何构建一个绝对基本的Dockerfile来运行shinyapp吗？我的Dockerfile中有没有过时的行？

我构建的Dockerfile：

FROM rocker/r-ver:3.5.1
#install necessary libraries
RUN R -e "install.packages(c('ggplot2','shiny'))"
COPY . /usr/local/src/app
WORKDIR /usr/local/src/app
CMD ["Rscript","app_run.R"]

非常感谢。

Answer 1

在我看来，你的Dockerfile只有一个小问题:这款闪亮的应用程序将在哪个端口上运行？默认情况下，shiny使用一个随机端口，当您运行docker容器并希望将某个单独的端口从容器映射到主机时，这并不是很有用。我通常这样使用端口3838：

FROM rocker/r-ver:3.5.1
#install necessary libraries
RUN R -e "install.packages(c('ggplot2','shiny'))" \
 && echo 'options(shiny.port = 3838, shiny.host = "0.0.0.0")' >> /usr/local/lib/R/etc/Rprofile.site \
 && rm -rf /tmp/*

EXPOSE 3838

COPY . /usr/local/src/app
WORKDIR /usr/local/src/app
CMD ["Rscript","app_run.R"]

稍后我可以使用

docker run -p 3838:3838 <shiny_image>

该应用程序将在http://localhost:3838上提供。

如果你想要小一点的，你可以用

FROM debian:buster-slim

RUN apt-get update \
 && apt-get install --yes --no-install-recommends \
            r-cran-shiny r-cran-ggplot2 \
 && echo 'options(shiny.port = 3838, shiny.host = "0.0.0.0")' >> /etc/R/Rprofile.site \
 && apt-get clean \
 && rm -rf /var/lib/apt/lists/*

EXPOSE 3838

COPY . /usr/local/src/app
WORKDIR /usr/local/src/app
CMD ["Rscript","app_run.R"]

如果没有所有的开发包，这可能会更小。