在BizTalk中实现FHIR JSON to XML解码

Question

我刚开始使用FHIR和json，所以我的问题可能没有被很好地问出来。

基于我在这里找到的示例http://soapfault.com/blog/2016/08/hl7-fhir-json-decoding-in-biztalk/，我使用这个库https://github.com/ewoutkramer/fhir-net-api构建了一个BizTalk管道组件，用于将FHIR-json转换为FHIR-xml。

下面是管道组件的代码片段。它与示例几乎完全相同。

//Read the json message
                        using (TextReader tr = new StreamReader(originalDataStream))
                        {
                            json = tr.ReadToEnd();
                        }

                        //Use FHIR-NET-API to create a FHIR resource from the json
                        Hl7.Fhir.Serialization.ResourceReader resourceReader = new Hl7.Fhir.Serialization.ResourceReader(FhirJsonParser.CreateFhirReader(json), ParserSettings.Default);

                        //Use FHIR-NET-API to serialize the resource to XML
                        byte[] resourceXmlBytes = Hl7.Fhir.Serialization.FhirSerializer.SerializeToXmlBytes(resourceReader.Deserialize());

管道组件能够解码以{ "resourceType": "ImagingStudy",开头的任何单个json FHIR消息。

但是我在像这样开始的消息上得到了一个解析错误，

{
  "resourceType" : "Bundle",
  "entry" : [{
      "resource" : {
        "resourceType" : "ImagingStudy",

或

{
  "entry": [
    {
      "fullUrl":     "http://fhirtest.uhn.ca/baseDstu2/ImagingStudy/EXexample",
      "resource": {
        "resourceType": "ImagingStudy",

这里有几个我得到的错误，

There was a failure executing the receive pipeline: "LALALA.Imaging.Pipelines.FHIRJasonDecoderRP, LALALA.Imaging.Pipelines, Version=1.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=19bb8b5ea64396aa" Source: "FHIRJsonDecoder" Receive Port: "RP_LA_Test_FILE" URI: "D:\Projects\LALALA.Imaging\In\*.json" Reason: Data at the root level is invalid. Line 1, position 1.

或

Reason: At line 1, pos 1: Cannot determine type of resource to create from json input data: no member resourceType was found

对于我的解决方案，最终目标是能够将成堆的冷杉图像研究消息解析成单个冷杉xml消息，然后将这些消息映射到HL7 ORU消息。

对于上述问题的任何帮助，或者关于如何使用BizTalk实现我的最终目标的建议，我们将不胜感激。

Answer 1

通常不需要直接调用ResourceReader，尽管如此，我还是尝试像这样重现您的错误：

var json = @"{
            ""resourceType"" : ""Bundle"",
            ""entry"" : [{
                  ""resource"" : {
                       ""resourceType"" : ""ImagingStudy""
                                       }}]}";

// SHORT VERSION: var b = new FhirJsonParser().Parse<Bundle>(json);
var b = new     
             Hl7.Fhir.Serialization.ResourceReader(
               FhirJsonParser.CreateFhirReader(json),  
                          ParserSettings.Default).Deserialize();

Assert.IsNotNull(b);

然而，两者都工作得很好。也许在读取流的时候出了什么问题？

您也可以尝试直接从流中读取：

var b = new FhirJsonParser().Parse<Bundle>(new 
                     Newtonsoft.Json.JsonTextReader(stream));