仅将clusters绘制到被切割的集群，而不是每一片叶子

Question

我有一个包含近2000个样本的hclust树。我已经将其切割成适当数量的集群，并希望绘制树状图，但在我切割集群的高度结束，而不是一直到每个单独的叶子。每个绘图指南都是关于通过群集或绘制方框来给所有树叶着色，但似乎没有任何东西只是完全离开了切割线下的树叶。

我的完整树状图如下所示：

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我想把它画出来，就好像它停在我在这里画的那条线一样(例如)：

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Answer 1

这应该可以让你开始学习了。我建议阅读“树状图”的帮助页面。

以下是帮助页面中的示例：

hc <- hclust(dist(USArrests))
dend1 <- as.dendrogram(hc)
plot(dend1)
dend2 <- cut(dend1, h = 100)
plot(dend2$upper)
plot(dend2$upper, nodePar = list(pch = c(1,7), col = 2:1))

通过对树状图对象(而不是hclust对象)执行剪切，您可以绘制树状图的上部。根据您的分析，替换branch1、2、3和4标签需要一些工作。

祝好运。