尝试读取大文件时，MPI_File_read_at_all提供了无效的计数参数

Question

我编写了一个简单的C程序来试用MPI-IO；该程序读取一个文本文件，每个进程输出它读取的部分的第一个字符。这个程序在不同的大小(100KB，30MB，500MB，2.5 got )下运行良好，但当我尝试7.5 got的文件时，我得到了这个错误：

Invalid count, error stack:
MPI_FILE_IREAD_AT(104): Invalid count argument

我尝试了集合方法(MPI_File_read_at_all)和独立方法(MPI_File_read)，它们都无法读取7.5 to的文件。这是负责读取的代码：

MPI_File fh;
MPI_Offset total_number_bytes, number_bytes;
long long nchars;
int errclass, resultlen;
char err_buffer[MPI_MAX_ERROR_STRING];    

MPI_File_open(MPI_COMM_WORLD, "bigfastq", MPI_MODE_RDONLY, MPI_INFO_NULL, &fh);
MPI_File_get_size(fh, &total_number_bytes);

number_bytes = total_number_bytes/size;
nchars = number_bytes/sizeof(char);
//char buf[nchars+1];
char *buf = (char*)malloc(sizeof(char)*nchars);
MPI_Offset offset = rank*number_bytes;

int err = MPI_File_read_at_all(fh, offset, buf, nchars, MPI_CHAR, &status);
if(err != MPI_SUCCESS){
    MPI_Error_class(err,&errclass);
    if (errclass== MPI_ERR_COUNT) {
        printf("Invalid count class!!\n");
    }
    MPI_Error_string(err,err_buffer,&resultlen);
    fprintf(stderr,err_buffer);

    MPI_File_close(&fh);
    MPI_Finalize();
    return 0;
}

MPI_File_close(&fh);

printf("rank: %d, buf[%lld]: %c, count: %lld\n", rank, offset, buf[offset], count);


MPI_Finalize();

你知道为什么在尝试7.5 it的文件时会出现这个错误吗？

提前感谢！

Answer 1

计数第四个参数( MPI_File_read_at_all() )是一个int。因此，您的long long可能会被截断为负整数。

您可以创建一个较大的派生数据类型，以便count适合有符号整数，或者执行几次较短的读取。