查找本体中使用的所有IRI，哪些不是实体？

Question

在OWLAPI中，有没有什么直接的方法可以找到本体中使用的所有IRI，这些IRI没有被标识为实体，即没有被声明，也没有在允许它们被标识为特定实体类型的上下文中使用？希望有类似于OWLOntology.signature()的东西，但什么也没看到。

这种情况的一个例子出现在BFO2.0 (http://purl.obolibrary.org/obo/bfo.owl)中：

<rdf:Description rdf:about="http://example.com/bfo-spec-label">
    <obo:IAO_0000119>Person:Alan Ruttenberg</obo:IAO_0000119>
</rdf:Description>

在这里，http://example.com/bfo-spec-label只是一个未知实体类型的“裸”IRI，因此不会出现在本体签名中。

Answer 1

我找不到任何优雅的方法来找到所有这些赤裸裸的IRI，但是可以通过查找所有可能出现的地方来找到它们。一个简单的方法看起来像这样:私有列表findBareIRIs(OWLOntology onto) { List bares =新的ArrayList()；

// bare IRIs can occur as AnnotationSubjects, AnnotationObjects or the domain/range of AnnotationProperties
List<OWLAnnotationAssertionAxiom> asserts = OWLAPIStreamUtils.asList(onto.axioms(AxiomType.ANNOTATION_ASSERTION));
List<OWLAnnotationPropertyDomainAxiom> domains = OWLAPIStreamUtils.asList(onto.axioms(AxiomType.ANNOTATION_PROPERTY_DOMAIN));
List<OWLAnnotationPropertyRangeAxiom> ranges = OWLAPIStreamUtils.asList(onto.axioms(AxiomType.ANNOTATION_PROPERTY_RANGE));

//check the subject and values of each AnnotationAsertion
for (OWLAnnotationAssertionAxiom ax : asserts) {
  OWLAnnotationSubject subj = ax.getSubject();
  OWLAnnotationValue value = ax.getValue();
  if (subj.isIRI()) {
    bares.add((IRI) subj);
  }
  if (value.isIRI()) {
    bares.add((IRI) value);
  }
}
// check the domain and ranges of each AnnotationProperty
for (OWLAnnotationPropertyDomainAxiom ax : domains) {
  bares.add(ax.getDomain());
}
for (OWLAnnotationPropertyRangeAxiom ax : ranges) {
  bares.add(ax.getRange());
}

return bares;

}