随机效应Cox模型

Question

我正在尝试绘制pm2.5暴露与高血压发病率之间的剂量-反应关系。我拟合了一个随机效应cox模型，其中为研究中心添加了一个随机效应。然后使用plotHR函数绘制剂量-反应关系图。但我遇到了一个错误。下面是我使用的示例R代码。

library(survival)
library(coxme) 
library(splines)
library(Greg)

data("eortc")
eortc$age<-rnorm(2323,40,10)

efit1 <- coxph(Surv(y, uncens) ~ ns(age) + trt , eortc)
plotHR(efit1,term = 1,xlim = c(30,70))

efit2 <- coxme(Surv(y, uncens) ~ ns(age) + trt + (1|center), eortc)
plotHR(efit2,term = 1,xlim = c(30,70))

我可以使用plotHR绘制efit1，但在绘制efit2时遇到错误，我在cox模型中添加了随机效果。有人知道如何解决这个问题吗？谢谢!

Answer 1

这显示了predict.coxme可以为这样的模型返回什么。我猜它不会完全令人满意，但我声称它是有用的，因为它展示了混合模型是什么样子的“在引擎盖下”。每个中心都有单独的预测，但由于没有声称这些中心有任何特定的分布，以其均值聚合它们的努力在统计上被认为是可疑的。这将绘制模型的指数化线性预测器，该模型包含一个没有结点的“样条”拟合(这会给你一串线)。我按trt状态着色:黑色代表"0“，红色代表"1”

plot( eortc$age, exp( predict(efit2)), col=1+(eortc$trt==1) )

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trt==0组和trt==1组之间的“平均”差异确实显示出来，并与exp(0.705) -> [1] 2.023847的测量治疗效果一致，并且在模型中不显著的“年龄”效应是一个非常浅的线性上升。