Java Web应用程序线程被java.net.SocketInputStream.socketRead0(本机方法)的DB操作卡住了

Question

我面临的问题是，有时web应用程序线程卡在java.net.SocketInputStream.socketRead0(本地方法)的DB operations.My应用程序服务器和DB服务器驻留在不同的虚拟机。请查看下面的JStack

"http-bio-9904-exec-10" #57 daemon prio=5 os_prio=0     tid=0x00007f1730007000 nid=0xfcd1 runnable [0x00007f171e6ee000]
java.lang.Thread.State: RUNNABLE
at java.net.SocketInputStream.socketRead0(Native Method)
at java.net.SocketInputStream.socketRead(SocketInputStream.java:116)
at java.net.SocketInputStream.read(SocketInputStream.java:170)
at java.net.SocketInputStream.read(SocketInputStream.java:141)
at com.mysql.cj.core.io.ReadAheadInputStream.fill(ReadAheadInputStream.java:101)
at com.mysql.cj.core.io.ReadAheadInputStream.readFromUnderlyingStreamIfNecessary(ReadAheadInputStream.java:144)
at com.mysql.cj.core.io.ReadAheadInputStream.read(ReadAheadInputStream.java:174)
- locked <0x00000000f6a35bb8> (a com.mysql.cj.core.io.ReadAheadInputStream)
at java.io.FilterInputStream.read(FilterInputStream.java:133)
at com.mysql.cj.core.io.FullReadInputStream.readFully(FullReadInputStream.java:58)
at com.mysql.cj.mysqla.io.SimplePacketReader.readHeader(SimplePacketReader.java:60)
at com.mysql.cj.mysqla.io.TimeTrackingPacketReader.readHeader(TimeTrackingPacketReader.java:48)
at com.mysql.cj.mysqla.io.MultiPacketReader.readHeader(MultiPacketReader.java:51)
at com.mysql.cj.mysqla.io.MysqlaProtocol.readPacket(MysqlaProtocol.java:521)
at com.mysql.cj.mysqla.io.MysqlaProtocol.checkErrorPacket(MysqlaProtocol.java:723)
at com.mysql.cj.mysqla.io.MysqlaProtocol.sendCommand(MysqlaProtocol.java:662)
at com.mysql.cj.mysqla.io.MysqlaProtocol.sqlQueryDirect(MysqlaProtocol.java:950)
at com.mysql.cj.mysqla.MysqlaSession.sqlQueryDirect(MysqlaSession.java:431)
at com.mysql.cj.jdbc.ConnectionImpl.execSQL(ConnectionImpl.java:1974)
- locked <0x00000000f6a2ce30> (a com.mysql.cj.jdbc.ConnectionImpl)
at com.mysql.cj.jdbc.ConnectionImpl.execSQL(ConnectionImpl.java:1936)
at com.mysql.cj.jdbc.StatementImpl.executeInternal(StatementImpl.java:891)
- locked <0x00000000f6a2ce30> (a com.mysql.cj.jdbc.ConnectionImpl)
at com.mysql.cj.jdbc.StatementImpl.execute(StatementImpl.java:795)
.
.
.
.

我使用tomcat 7.0.57和tomcat池化作为DB池，下面是池化配置

 <Resource name="jdbc/xyz" auth="Container" 
type="javax.sql.DataSource"     
maxTotal="100" 
maxIdle="30"      
factory= "com.XXX.tomcat.jndi.EncryptedDataSourceFactory"            

maxWaitMillis="10000" 
username="abc" password="abcdef" 
driverClassName="com.mysql.jdbc.Driver"       
url="jdbc:mysql://x.y.z.w:3306/some_db" 
testOnBorrow="true" validationQuery="SELECT 1">
</Resource>

我检查了数据库服务器(Mysql 5.6.34)的一般日志，发现查询在几分钟后到达数据库服务器(在5-20分钟之间变化)。有时查询( insert/select)的执行时间只有几分之一秒。

在应用程序级别的TCP转储中也显示了相同的结果，其中存在5-20分钟的延迟。

一些观察:有一段时间，比如5-10分钟，在这段时间内，如果请求被触发，则在15分钟后获得响应，在这5-10分钟之后，所有查询将在接下来的30-40分钟内平稳地工作。

使用的Mysql驱动是5.1.0。

请帮助我找出问题所在。

Answer 1

最后，我得到了面对类似问题的problem.People，可以尝试同样的问题。这实际上是我的网络中防火墙的结果。我使用连接池设置解决了它。最终的池配置使它对我来说是有效的。

<Resource name="jdbc/xxx"
    auth="Container"
    type="javax.sql.DataSource"
    factory="com.yyy.tomcat.jndi.EncryptedDataSourceFactory"
    username="xyz"
    password="abc"
    driverClassName="com.mysql.jdbc.Driver"
    url="jdbc:mysql://x.x.x.x:3306/abc?enableQueryTimeouts=true&amp;autoReconnect=true&amp;autoReconnectForPools=true"
    initialSize="0"
    maxTotal="100"
    maxActive="100"
    minIdle="0"
    maxWait="1000"
    testOnBorrow="true"
    testWhileIdle="true"
    validationQuery="SELECT 1"
    validationInterval="30000"
    validationQueryTimeout="1"
    timeBetweenEvictionRunsMillis="30000"
    minEvictableIdleTimeMillis="30000"
    removeAbandonedTimeout="10"
    removeAbandoned="true"
    logAbandoned="true"
    logValidationErrors="true"
    connectionProperties="[enableQueryTimeouts=true]"
    jdbcInterceptors="ConnectionState;QueryTimeoutInterceptor(queryTimeout=1);SlowQueryReport;ResetAbandonedTimer">