Geom_violin + geom_error_bar

Question

我有3个物体的500个估计值。我的目标是绘制一个小提琴图，以了解估计的分布，但同时，我希望可视化标准误差(以另一种方式评估)、平均值估计和真实值。

这就是我所拥有的：

object1 <- rnorm(500,mean=1,sd=0.1)
object2 <- rnorm(500,mean=2,sd=0.1)
object3 <- rnorm(500,mean=3,sd=0.1)

estimations <- data.frame(object1,object2,object3)
colnames(estimations) <- 1:3

SEframe <- data.frame()
SEframe <- rbind(SEframe,c(1,1,mean(object1),0.1))
SEframe <- rbind(SEframe,c(2,2,mean(object2),0.15))
SEframe <- rbind(SEframe,c(3,3,mean(object3),0.25))

colnames(SEframe) <- c("ID","True.value","Estimated.value","SE")

estMelted <- melt(estimations)
estMelted$variable <- as.factor(estMelted$variable)

p <- ggplot(estMelted, aes(x=variable, y=value)) + 
  geom_violin()

现在我希望在图上有一条代表真实值的线，以及一个用于估计和SE的误差条。

我该怎么做呢？

Answer 1

您可以随时为其他层指定另一个数据集。在这里，我们添加了一个geom_errorbar层和一个geom_point层，这两个层都用于data=SEframe。

p + 
  geom_errorbar(data=SEframe, aes(x=ID, 
             ymin=Estimated.value - SE, 
             ymax=Estimated.value+SE), inherit.aes=F) + 
  geom_point(data=SEframe, aes(x=ID, y=Estimated.value))

注意inherit.aes=FALSE的用法。原因如下:默认情况下，geom_errorbar将从ggplot()继承映射，但该映射使用名为value的列。即使geom_errorbar不需要它(因为它不需要y)，它仍然会被继承并导致问题。因此，我们指定不应继承aes。