如何在Shiny中绘制带有heatmaply包的热图？

Question

我正在尝试使用heatmaply包来绘制热图，它工作得很好。

另一方面，当我尝试在Shiny中做同样的绘图时，它不会出现在界面上(当我点击“运行应用”时)。但是，当我关闭窗口时，绘图突然出现在R查看器中。有没有可能heatmaply套装不能与Shiny一起工作？

这是我的代码，当我在R中绘制它时。

library(heatmaply)
x  <- as.matrix(datasets::mtcars)
rc <- colorspace::rainbow_hcl(nrow(x))

heatmaply(
  x[, -c(8, 9)],
  col_side_colors = rc[1:9],
  showticklabels=FALSE,
  Rowv = TRUE,
  Colv = FALSE
)

这是我在Shiny中的代码。

library(shiny)
library(heatmaply)

ui <- fluidPage(

    # Application title
    titlePanel("Heatmap"),

    sidebarLayout(
        sidebarPanel(
            
        ),

        # Show a plot of the generated distribution
        mainPanel(
           plotOutput("distPlot")
        )
    )
)
x  <- as.matrix(datasets::mtcars)
rc <- colorspace::rainbow_hcl(nrow(x))

server <- function(input, output) {

    output$distPlot <- renderPlot({
        heatmaply(
          x[, -c(8, 9)],
          col_side_colors = rc[1:9],
          showticklabels=FALSE,
          Rowv = TRUE,
          Colv = FALSE
        )

     })
}

# Run the application 
shinyApp(ui = ui, server = server) 

我已经尝试了另一个软件包来提供交互式热图，但它是唯一一个具有我想要的东西的软件包，因此我需要在这里询问是否有人知道如何在Shiny中使用它。

提前谢谢你，

问候

Answer 1

您可以使用plotlyOutput和renderPlotly：

library(shiny)
library(heatmaply)
library(plotly)

ui <- fluidPage(
  
  # Application title
  titlePanel("Heatmap"),
  
  sidebarLayout(
    sidebarPanel(
      
    ),
    
    # Show a plot of the generated distribution
    mainPanel(
      plotlyOutput("distPlot")
    )
  )
)
x  <- as.matrix(datasets::mtcars)
rc <- colorspace::rainbow_hcl(nrow(x))

server <- function(input, output) {
  
  output$distPlot <- renderPlotly({
    heatmaply(
      x[, -c(8, 9)],
      col_side_colors = rc[1:9],
      showticklabels=FALSE,
      Rowv = TRUE,
      Colv = FALSE
    )
    
  })
}

# Run the application 
shinyApp(ui = ui, server = server) 

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此外，还有一个可能感兴趣的包shinyHeatmaply。