nul数据中字符串中嵌入的nul

Question

使用R，我正在使用fread读取一个文件，它是一个有很多列和行的文件。该文件如下所示：

1_17118 1_18353 1_21882 1_21955 1_22054
Ind0001  -1      -1      -1      -1
Ind0002  -1      -1      -1      -1
Ind0003  -1      -1      -1      -1
Ind0005  -1      -1      -1      -1
Ind0006  -1      -1      -1      -1

我把这个文件写成这样：

M <- fread("file.txt")

我得到了下一个错误：

Error in fread("file.txt") :
  embedded nul in string: '\xff\xff\xff\001\0\0'
Execution halted

我读了另一个看起来非常相似的文件，我以前没有遇到过这个问题。

我的列，除了标题和第一列有-1，1和0。我猜在-1，1和0中应该有一个字符串，这就是导致问题的原因。你知道我如何识别文件中的任何字符串吗？我尝试了使用grep的几种可能性。但我不确定如何查找任何字符串。你知道我该怎么解决这个问题吗？

Answer 1

在我的例子中，fread的问题是我的文件大小(2.7G)。使用R版本3.6.0，fread无法读取整个文件。解决方案是将我的文件拆分为两个较小的文件。然后我执行rbind来合并这两个文件，之后一切都正常工作。