我有两个数据帧。一个是具有列和行标题的矩阵,另一个是矩阵的元数据。矩阵的当前行名和列名是登录号,但我在数据框架中还有其他名称,我将在其中使用这些名称作为行/列名。问题是它们的顺序不同。我希望在元数据中找到与矩阵中的行/列匹配的行,并将矩阵的行/列名更改为与第二个数据帧中的不同列匹配的名称。
矩阵:
"XP01020938" "XP3943847" "XP39583574" "XP39384739"
"XP01020938" 1 0.5 0.25 0.1
"XP3943847" 0.5 1 0.5 0.25
"XP39583574" 0.25 0.5 1 0.1
"XP39384739" 0.1 0.25 0.1 1元数据:
Accession Name
XP3943847 Tiger
XP39583574 Elephant
XP39384739 Monkey
XP01020938 Horse所需:
"Horse" "Tiger" "Elephant" "Monkey"
"Horse" 1 0.5 0.25 0.1
"Tiger" 0.5 1 0.5 0.25
"Elephant" 0.25 0.5 1 0.1
"Monkey" 0.1 0.25 0.1 1发布于 2019-07-26 14:32:16
使用match做这样的事情?
colnames(mat) <- metadata$Name[match(colnames(mat), metadata$Accession)]
rownames(mat) <- metadata$Name[match(rownames(mat), metadata$Accession)]
mat
# Horse Tiger Elephant Monkey
#Horse 1.00 0.50 0.25 0.1
#Tiger 0.50 1.00 0.25 0.1
#Elephant 0.25 0.50 1.00 0.1
#Monkey 0.10 0.25 0.50 1.0https://stackoverflow.com/questions/57214268
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