如何在其子文件中的第2列包含值范围(-6到-7)的文件名？

Question

我有5000个目录(从ligand_0001到ligand_5000 )。每个包含的子文件名为log.txt，其中包含第2列的分数。我想提取所有这些目录名(ligand_*)，这些目录名在第二列中有一个包含-6到-7分数的日志文件。

   1         -6.1      0.000      0.000
   2         -6.1      2.657      3.713
   3         -5.9     26.479     28.383
   4         -5.9     27.924     30.549
   5         -5.8      4.579      8.657
   6         -5.8     26.841     28.725
   7         -5.8     25.192     27.089
   8         -5.6      3.119      4.640

这是ligand_0005文件夹中的子文件(log.txt)。我只想要文件夹的名称，因为它在第2列中包含-6到-7值(即ligand_0005)

Answer 1

这是一个小的awk脚本，可以在一次扫描中扫描所有文件。

script.awk

BEGINFILE{ # on every file
    pathPartsLen = split(FILENAME,pathParts, "/"); # split path to its parts into arry pathParts
    currentDir = pathParts[pathPartsLen - 1]; # find the current parent dir
}
$2 ~ "^-[67]" { # match 2nd field to start with -6 or -7
    print currentDir;
    nextfile; # skip the rest of the file, goto next file
}

运行：

awk -f script.awk $(find ligand_* -name log.txt)

解释：

find ligand_* -name log.txt：列出目录ligand_*中的所有log.txt文件

Answer 2

使用awk找出第二列中是否存在数字，遍历文件夹并检查每个文件夹的log.txt

ARRAY=()
for i in ligand_*
do
  if [[ ! -z $(awk '$2>=-7 && $2<=-6' ${i}/log.txt) ]]
  then
   ARRAY+=("${i}")
  fi
done
printf '%s\n' "${ARRAY[@]}"