有没有办法调整'letsR‘图中图例中物种数量的比例？

Question

因此，我一直在使用'letsR‘包为东南亚的一组鸟类构建范围图。

有人知道是否可以调整或缩放图例吗？我主要使用此博客来帮助构建地图https://rmacroecology.netlify.com/2018/01/23/a-guide-to-transform-species-shapefiles-into-a-presence-absence-matrix-based-on-a-user-defined-grid-system/

我在小插曲中检查了所有地方，但没有看到这一点。我也给创建这个包的人发了电子邮件，但没有成功。

我想要做的是将所有的传说相对于物种最多的地图进行缩放，即60种(最高记录)= 100。在那一刻，所有这些红色区域看起来都是一样的。有没有可能对颜色进行渐变，例如，对于包含较少物种范围的地图中物种重叠的区域，一个红色是较浅的？最终，规模将被标准化为60

Plots

Answer 1

我快速浏览了他们在Github上的代码。我确实认为你必须重新构建一个函数来绘制存在-缺席矩阵，但它看起来并没有那么糟糕--特别是如果你仔细学习他们的例子的话。他们的绘图代码非常简短，而且很容易复制。

相关的部分在他们的绘图代码中：https://github.com/macroecology/letsR/blob/master/R/plot_PresenceAbsence.R#L44-L53

    # Getting values  
    v <- values(x$Rich)
    c <- max(v, na.rm = TRUE)

    # Set zero to NA
    v[(v == 0)] <- NA
    values(x$Rich) <- v

    # Plot, add one and remove the first to not be white.
    plot(x$Rich, col = colfunc(c + 1)[-1], ...)  

他们将变量c设置为每个绘图的最大值，但您可以直接将其设置为您认为是一致最大值的任何值。复制它们的绘图功能，但替换第二行中的c赋值可能会得到标准化比例所需的内容。