对分组数据迭代执行方差分析(使用ezANOVA

Question

创建sample_data：

norm_power <- rnorm(2298) 
phoneme <- c("t", "v", "s", "p")
intensity <- c("loud", "soft")
unique_ID <- as.factor(rep(c("elec1", "elec2", "elec3", "elec4", "elec5", "elec6", "elec7",
                   "elec8", "elec9", "elec10"), length.out = 2298))

Subject <- as.factor(rep(c("DBS1", "DBS2", "DBS3", "DBS4"), length.out = 2298))    
sample_data <- data.frame(norm_power, unique_ID, Subject, stringsAsFactors = FALSE)    
sample_data$intensity[sample(1:nrow(sample_data), nrow(sample_data), FALSE)] <- rep(intensity, c(1149,1149))    
sample_data$phoneme[sample(1:nrow(sample_data), nrow(sample_data), FALSE)] <- rep(phoneme, c(574, 574, 575, 575))

我正在尝试对样本数据的多个子集执行方差分析并提取系数-参见上文。当我将数据集过滤成单独的电极(即"elec1")时，我能够得到一个结果(参见输出)：

sample_data_elec1 <- filter(sample_data, unique_ID == "elec1")

output <-ezANOVA(dv = norm_power, within=.(phoneme, intensity), wid=Subject, data=sample_data_elec1)

然而，当我试图一次在sample_data的多个“子集”上完成类似的操作时，我只为所有操作生成NAs。参见下面的'anova_data‘：

get_coefs <-function(d){

  output <-ezANOVA(dv = norm_power, within=.(phoneme, intensity), wid=Subject, data=d)

  tibble('phoneme_F' = output[["ANOVA"]][[4]][1], "phoneme_pval" = output[["ANOVA"]][[5]][1], 
         "intensity_F" = output[["ANOVA"]][[4]][2], "intensity_pval" = output[["ANOVA"]][[5]][2], 
         "interact_F" = output[["ANOVA"]][[4]][3], "interact_pval"= output[["ANOVA"]][[5]][3])
}

anova_data <- sample_data %>% 
  group_by(unique_ID) %>% 
  do({get_coefs(.)}) %>% 
  ungroup()

提前感谢您的帮助-请让我知道，如果我可以进一步澄清！

Answer 1

您会得到这个错误，因为您正在运行重复测量anova的测试。它有一个非常严格的设计，使用来自this website的示例

library(ez)
bilingual=read.delim("http://coltekin.net/cagri/R/data/bilingual.txt")
# this works
ezANOVA(data=bilingual,dv=mlu,wid=.(subj),
within=.(language, age), between=gender)

你可以看到，对于每个受试者，你实际上只有一次测量之前/之后或每个因素的组合。

table(bilingual$age,bilingual$language,bilingual$subj)

, ,  = 1


              home.only school
  firstgrade          1      1
  preschool           1      1
  secondgrade         1      1

, ,  = 2


              home.only school
  firstgrade          1      1
  preschool           1      1
  secondgrade         1      1

返回到您的示例，您需要使用within_full，因为您有多个度量，您的一些示例数据集可以工作，但您可以看到有一些抱怨，这是理所当然的，因为该设计不适用于此测试：

output <-ezANOVA(dv = norm_power,between=.(phoneme, intensity), within_full=.(phoneme, intensity), wid=.(Subject), data=droplevels(sample_data_elec1))

而且，根据重复测量，您还缺少我在上面为您填写的间隔效果。现在，如果您的研究或测试不是针对repeated measure anova的，那么只需将您想要测试的所有变量放在以下各项之间：

output <-ezANOVA(dv = norm_power,between=.(phoneme, intensity), wid=.(Subject), data=droplevels(sample_data_elec1))