将由换行符分隔的python字符串文件解析为json数组。

Question

我有一个名为path_text.txt的文件，它的内容是由换行符分隔的两个字符串：

/gp/oi/eu/gatk/inputs/NA12878_24RG_med.hg38.bam 
/gp/oi/eu/gatk/inputs/NA12878_24RG_small.hg38.bam

我希望有一个像这样的json数组对象：

["/gp/oi/eu/gatk/inputs/NA12878_24RG_med.hg38.bam","/gp/oi/eu/gatk/inputs/NA12878_24RG_small.hg38.bam"]

我尝试过这样的东西：

with open('path_text.txt','w',encoding='utf-8') as myfile:
    myfile.write(','.join('\n'))

但是它不起作用。

Answer 1

首先，我不知道您实际上是从哪里读取文件的。在正确格式化path_text.txt之前，您必须实际读取它，对吗？

with open('path_text.txt','r',encoding='utf-8') as myfile:
    content = myfiel.read().splitlines()

这将在content中为您提供['/gp/oi/eu/gatk/inputs/NA12878_24RG_med.hg38.bam', '/gp/oi/eu/gatk/inputs/NA12878_24RG_small.hg38.bam']。

现在，如果您想将此数据写入["/gp/oi/eu/gatk/inputs/NA12878_24RG_med.hg38.bam", "/gp/oi/eu/gatk/inputs/NA12878_24RG_small.hg38.bam"]格式的文件-

import json

with open('path_json.json', 'w') as f:
    json.dump(content, f)

现在，path_json.json文件看起来像-

["/gp/oi/eu/gatk/inputs/NA12878_24RG_med.hg38.bam", "/gp/oi/eu/gatk/inputs/NA12878_24RG_small.hg38.bam"]

如果您想要从文件中加载json，它是有效的json。

Answer 2

见下文

with open('path_text.txt') as f:
    data = [l.strip() for l in f.readlines()]