R maptools rpy2中的wrld_simpl

Question

在R中：

import(maptools)
data(wrld_simpl)

在python rpy2中，如何访问wrld_simpl？以下代码(在Python中)失败，如下所示...package "maptools" has no attribute wrld_simpl

maptools = importr('maptools')
data = DataFrame(maptools.wrld_simpl)

只是想要理解rpy2 (重温大学时代的R)

Answer 1

使用rpy2.robjects.packages.data，如rpy2 introduction中所示

>>> from rpy2.robjects.packages import importr, data

>>> maptools = importr('maptools')
>>> spatial_df_r = data(maptools).fetch('wrld_simpl')['wrld_simpl']
>>> spatial_df_r
<rpy2.robjects.methods.RS4 object at 0x7ffa932b0cc0> [RTYPES.S4SXP]
R classes: ('SpatialPolygonsDataFrame',)

您似乎还在尝试将数据转换为pandas.DataFrame。小问题是数据不是数据框，而是SpatialPolygonsDataFrame对象。但是，您可以将其转换为适当的data.frame

>>> base = importr('base')
>>> df_r = base.as_data_frame(spatial_df_r)
>>> tuple(df_r.rclass)
('data.frame',)

然后是熊猫DataFrame：

from rpy2.robjects import conversion
from rpy2.robjects import default_converter, pandas2ri

with conversion.localconverter(default_converter + pandas2ri.converter):
    df = conversion.rpy2py(df_r)

其中df现在是一只熊猫DataFrame：

>>> type(df)
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>

但是，如果您使用的是Jupyter，使用rpy2 magic的-o选项可以更容易地完成转换，请参阅：using rpy2 in notebooks和rpy2.ipython.rmagic。