如何使用R中的循环在多个条件下设置矩阵的子集？

Question

示例矩阵(输入) enter image description here

  Species   PH  PNH
    A   1   10
    B   2   11
    C   3   12
    D   4   13
    E   5   14
    F   6   15
    G   7   16
    H   8   17
    I   9   18

我想使用多个条件的集合来子集R中的一个矩阵-

Subset 1 for Condition 1: PH >= 5 and PNH >= 15
Subset 2 for Condition 2: PH >= 3 and PNH >= 13

S1<-subset(Input, Input$PH >= 5 & Input$PNH >= 15)
S2<-subset(Input, Input$PH >= 3 & Input$PNH >= 13)

对于所有子集(S1和S2)的每一列(PH和PNH)，我必须计算香农多样性-

S1_shannon<-diversity(S1, 2, index="shannon")
S2_shannon<-diversity(S2, 2, index="shannon")

所以我的问题是“如何在循环中为多个条件设置矩阵的子集，如示例所示？”这样我就可以使用生成的子集来计算多样性。我将非常感谢来自社区的任何帮助。谢谢

Answer 1

您可以轻松地将其子集设置为：

sub_1<-df %>% 
  filter(PH>=5,PNH>=15)
sub_2<-df %>% 
       filter(PH>=3,PNH>=13)

我对shannon diversity.不太了解，假设你会先把它变成一个data.frame。