如何从Docker容器启动指定的conda环境？

Question

我正在尝试创建一个用于深度学习的容器，其中包含一个包列表，并同时支持Python2和Python3。我创建了一个Dockerfile，该文件从nvidia/cuda:10.1-cudnn7-devel-centos7中提取，然后安装Miniconda，然后创建Python2和3环境，如下所示：

RUN conda env create -f py2_env.yaml
RUN conda env create -f py3_env.yaml

环境文件如下所示：

name: py3
channels:
  - conda-forge
  - defaults
dependencies:
  - _libgcc_mutex=0.1=main
  - _tflow_select=2.1.0=gpu
  - lots_of_other_packages
  - pip:
    - affine==2.3.0
    - more_packages_here
prefix: /opt/conda/envs/py3

我遇到的问题是，当我创建容器时，我是从没有所有包的基础环境开始的，所以我从python 3环境开始，而不是从包含所有包的环境开始。我必须通过conda activate py3来获取它们。我想删除这一步。我希望将我的所有软件包直接安装到基本环境中，或者从激活的py3环境开始。我尝试将这个命令添加到我的Dockerfile：RUN /bin/bash -c "conda init bash && source /root/.bashrc && conda activate py3中，但它仍然在基本环境中启动。

Answer 1

将此行添加到docker文件的末尾

CMD ["/bin/sh " "conda init bash && source /root/.bashrc && conda activate py3"]