Biopython SeqIO错误:在赋值之前引用了局部变量'qual‘

Question

我给一家商业机构送了一些Sanger测序的样本。我可以使用下面的命令读取他们发送的文件

from Bio import SeqIO
from Bio import Seq
rec = SeqIO.read("isolation-round4/3dr23_Forward.ab1",'abi-trim').seq

但最近，由于搬家，我们不得不把样本送到其他地方进行测序。现在，如果我尝试在输出上运行相同的命令，我会得到一个错误：

File "C:\Users\Anaconda3\lib\site-packages\Bio\SeqIO\AbiIO.py", line 462, in AbiIterator letter_annotations={"phred_quality": qual}中的UnboundLocalError: local variable 'qual' referenced before assignment

如果能帮助我解决这个问题，我将不胜感激。这里是two files，一个可以工作，一个不能，如果你想看看的话。

提前感谢您的帮助！

Answer 1

Biopython 1.77中的错误应该已经修复

更新:查看https://github.com/biopython/biopython/issues/3221 -原来是ABI软件的一个新的意外配置，生成的文件没有质量分数。