fviz_mclust中的轴定义

Question

我已经使用Mclust软件包进行了潜在聚类分析。可视化集群时，轴标签为Dim1和Dim2。标签是什么意思或表示什么？是PCA维度吗？下面是一个显示聚类图- https://rpkgs.datanovia.com/factoextra/reference/fviz_mclust.html的示例

Answer 1

是的，它是前两个主成分，标签中的百分比表示每个成分解释的方差比例。您可以像这样重新创建它：

library(mclust)
library(factoextra)
data("diabetes")
mc <- Mclust(diabetes[, -1])

fviz_mclust(mc, "classification", geom = "point")

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pca = prcomp(scale(mc$data))
pca_plot = data.frame(pca$x,cluster = factor(mc$classification))
variance_explained = round(100*(pca$sdev^2)/sum((pca$sdev^2)),1) 

ggplot(pca_plot,aes(x=PC1,y=PC2,col=cluster)) + 
geom_point()+
xlab(paste("PC1 : ",variance_explained[1],"%"))+
ylab(paste("PC2 : ",variance_explained[2],"%"))

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