强制gnu-parallel将替换字符串视为命令

Question

我希望在使用替换字符串(例如：{%})时，将一个包含命令列表的文件传递给gnu-parallel。

不幸的是，如果使用替换字符串，gnu-parallel会将文件中的命令解释为/bin/bash的参数。

这是我想要做的：

parallel -j 8 'CUDA_VISIBLE_DEVICES=$(({%} - 1)) {}' < commands.txt

其中，commands.txt的内容是：

/path/to/binary -arg1 a -arg2 1.0
/path/to/binary -arg1 a -arg2 1.1
...
/path/to/binary -arg1 z -arg2 9.9

但是，这会引发以下错误：

/bin/bash: /path/to/binary -arg1 a -arg2 1.0: command not found

我希望GNU并行运行：

CUDA_VISIBLE_DEVICES=0 /path/to/binary -arg1 a -arg2 1.0

环境变量CUDA_VISIBLE_DEVICES的目的是让每个进程在不同的GPU上运行(默认情况下，所有进程都在同一个GPU上运行)。如果我不需要CUDA_VISIBLE_DEVICES，下面的代码就可以完美地工作了：

parallel -j 8 < commands.txt

我怎么才能避免这个问题呢？

Answer 1

虽然--colsep有时可以工作，但它并不总是正确的选择。这将创建文件abc和def

echo 'touch abc\ def' | parallel -v --colsep ' ' A=B {}

通常，使用eval去掉表达式的引号会更好

echo 'touch abc\ def' | parallel -v eval A=B {}

所以：

parallel -j 8 'eval CUDA_VISIBLE_DEVICES=$(({%} - 1)) {}' < commands.txt

如果您经常使用$(({%} - 1))，请考虑使用您自己的替换字符串：

echo '--rpl {%-1}\ $_=slot()-1' >> ~/.parallel/config
parallel -j 8 'eval CUDA_VISIBLE_DEVICES={%-1} {}' < commands.txt

或者甚至是：

echo '--rpl '"'"'{CUDA} $_="CUDA_VISIBLE_DEVICES=".(slot()-1)'"'" >> .parallel/config
parallel -j 8 'eval {CUDA} {}' < commands.txt

Answer 2

使用--colsep ' '可以做到这一点：

parallel -j 8 --colsep ' ' 'CUDA_VISIBLE_DEVICES=$(({%} - 1)) {}' < commands.txt